More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0489 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 147 aa  295  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  76.87 
 
 		 147 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4177  AraC family transcriptional regulator  81.51 
 
 		 147 aa  227  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0005743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  81.06 
 
 		 139 aa  226  9e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  73.83 
 
 		 150 aa  221  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  75.18 
 
 		 160 aa  215  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  73.76 
 
 		 148 aa  215  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  69.33 
 
 		 156 aa  210  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  71.43 
 
 		 143 aa  209  7.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  76.6 
 
 		 149 aa  209  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  73.13 
 
 		 146 aa  207  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  73.13 
 
 		 146 aa  207  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  73.13 
 
 		 146 aa  207  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  72.39 
 
 		 147 aa  202  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  74.47 
 
 		 151 aa  201  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2902  transcriptional regulator, AraC family  75.41 
 
 		 148 aa  200  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000233249  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2347  AraC family transcriptional regulator  74.6 
 
 		 153 aa  199  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.745211  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  74.24 
 
 		 156 aa  197  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3172  transcriptional regulator, AraC family  73.94 
 
 		 147 aa  197  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984429 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  72.22 
 
 		 144 aa  196  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  76.47 
 
 		 148 aa  180  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  64.71 
 
 		 145 aa  179  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  64.44 
 
 		 141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  69.83 
 
 		 155 aa  174  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2622  AraC family transcriptional regulator  84.54 
 
 		 144 aa  167  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  60.14 
 
 		 154 aa  164  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  71.93 
 
 		 134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  61.24 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  61.26 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  58.1 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  45.86 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  50.41 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  47.66 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  45.52 
 
 		 158 aa  104  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  40.5 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  41.32 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  41.18 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  40.74 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  42.15 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 		 156 aa  94  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  37.96 
 
 		 176 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  38.64 
 
 		 168 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 		 162 aa  91.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  38.64 
 
 		 168 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 168 aa  87.8  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1506  AraC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 182 aa  87  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  37.6 
 
 		 153 aa  84.3  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  43.14 
 
 		 322 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  33.94 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 311 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 311 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 311 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  40.57 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  37.38 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  37.39 
 
 		 287 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  37.39 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 306 aa  75.5  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 513 aa  74.7  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  30.51 
 
 		 286 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  39.42 
 
 		 324 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  40.2 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  41.05 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 292 aa  72  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  38.78 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  35.65 
 
 		 304 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 301 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 301 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  37.93 
 
 		 287 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  33.61 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 316 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  34.69 
 
 		 291 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0874  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 296 aa  70.5  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 316 aa  70.1  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 315 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 315 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 315 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 301 aa  70.1  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 291 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 305 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 305 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  31.48 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  36.61 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 332 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>