More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0450 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0450  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
349 aa  688    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0035112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 
207 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 
206 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  33.33 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  32.72 
 
 
200 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
200 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 
200 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1665  hypothetical protein  28.81 
 
 
313 aa  62.4  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0645935 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 
199 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4351  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 
204 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.710621  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 
210 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 
194 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 
238 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 
218 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02306  ISXo5 transposase  32.14 
 
 
338 aa  57  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 
194 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 
203 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3333  hypothetical protein  36.36 
 
 
338 aa  56.2  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.664615  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3539  hypothetical protein  36.36 
 
 
338 aa  56.2  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0781  hypothetical protein  36.36 
 
 
338 aa  56.2  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2206  hypothetical protein  36.36 
 
 
338 aa  56.2  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48827  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00331  ISXo5 transposase  34.88 
 
 
338 aa  56.2  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01861  ISXo5 transposase  32.14 
 
 
338 aa  56.2  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.485604  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02827  ISXo5 transposase  34.88 
 
 
338 aa  56.2  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 
209 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1156  ISSpo8, transposase  31.58 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0302963  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04224  ISXo5 transposase  34.88 
 
 
338 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0733056  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  29.63 
 
 
246 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
221 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 
211 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2800  hypothetical protein  31.03 
 
 
150 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0521952  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
243 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02759  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  53.9  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.890391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01473  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  53.9  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03560  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
341 aa  53.9  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.81013  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 
206 aa  53.9  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5836  hypothetical protein  36.45 
 
 
329 aa  53.1  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00040  ISXo5 transposase  33.33 
 
 
338 aa  53.1  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.765513  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  20.99 
 
 
200 aa  53.5  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03119  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  53.1  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 
308 aa  53.5  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 
213 aa  53.1  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01494  ISXo2 putative transposase  33.72 
 
 
333 aa  53.1  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01918  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.684506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 
199 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03338  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00429  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.901373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00947  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000842303  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06250  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00625171  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06059  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000704128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01857  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  53.1  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03664  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03353  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02455  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00868  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  53.1  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16246  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06219  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0124141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03214  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01069  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.168183  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02567  transposase  33.72 
 
 
277 aa  52.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02591  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.317416  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02578  ISXo5 transposase  31.25 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04634  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  23.9 
 
 
211 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00592  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  23.9 
 
 
211 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03780  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02486  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05836  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.979452  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02023  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273323  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03976  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.84431  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03012  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04081  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04330  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000810616  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06032  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.978605  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01807  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.156782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02993  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528498  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03695  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06092  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01870  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02971  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03315  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02593  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04595  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  27.62 
 
 
203 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04109  ISXo2 putative transposase  33.72 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.933255  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1278  ISSpo3, transposase  25.31 
 
 
292 aa  52  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38837  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01491  transposase  33.72 
 
 
277 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
233 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02617  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02702  ISXo5 transposase  33.72 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.222301  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1964  hypothetical protein  35.51 
 
 
333 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2430  hypothetical protein  35.51 
 
 
333 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.762343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2804  hypothetical protein  35.51 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.323871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4157  hypothetical protein  35.51 
 
 
333 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 
211 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0819  ISSod11, transposase  26.42 
 
 
318 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2210  ISSod11, transposase  26.42 
 
 
318 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2284  ISSod11, transposase  26.42 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>