More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0446 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0446  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
963 aa  1778    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00639292 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  33.56 
 
 
1146 aa  215  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  30.69 
 
 
1151 aa  164  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  33.85 
 
 
955 aa  139  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2880  transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 
905 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349194  hitchhiker  0.00245203 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0596  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  36.15 
 
 
385 aa  121  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal  0.0280718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2953  transcriptional regulator, LuxR family  31.03 
 
 
901 aa  115  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4029  ATPase-like protein  32.23 
 
 
758 aa  110  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00633058  normal  0.086403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  28.54 
 
 
998 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  26.61 
 
 
929 aa  100  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  32.72 
 
 
966 aa  100  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  32.29 
 
 
954 aa  100  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  30.3 
 
 
1402 aa  99.4  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  30.53 
 
 
1029 aa  99.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  32.3 
 
 
1075 aa  98.2  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  28.26 
 
 
1015 aa  97.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  25.69 
 
 
919 aa  97.4  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  27.25 
 
 
786 aa  97.4  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0558013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  34.26 
 
 
668 aa  97.8  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  31.88 
 
 
992 aa  95.1  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2675  Tetratricopeptide TPR_4  38.28 
 
 
870 aa  94.7  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00129539  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4714  transcriptional regulator, LuxR family  38.82 
 
 
929 aa  94.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  24 
 
 
1908 aa  94.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  29.46 
 
 
1022 aa  94  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  27.29 
 
 
919 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  27.29 
 
 
919 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  31.53 
 
 
1006 aa  92.8  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  31.61 
 
 
947 aa  92.8  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.39 
 
 
1055 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  29.46 
 
 
723 aa  91.7  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  23.28 
 
 
2279 aa  91.7  6e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  30.16 
 
 
1051 aa  91.7  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.56 
 
 
1429 aa  91.3  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.86 
 
 
981 aa  90.9  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  28.48 
 
 
1105 aa  90.5  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  29.71 
 
 
1122 aa  90.9  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  27.21 
 
 
2272 aa  90.1  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  27.05 
 
 
919 aa  90.1  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  28.6 
 
 
1885 aa  89.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.39 
 
 
1422 aa  89  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  29.55 
 
 
1118 aa  88.2  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  32.24 
 
 
956 aa  87.4  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.01 
 
 
1080 aa  87.4  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 
1349 aa  87  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  33.42 
 
 
1054 aa  85.5  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
1000 aa  84.3  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  31 
 
 
1342 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  29.06 
 
 
1403 aa  84  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.61 
 
 
1141 aa  83.2  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  29.93 
 
 
1348 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3369  transcriptional regulator, LuxR family  28.8 
 
 
872 aa  82.4  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  26.46 
 
 
1871 aa  82.8  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.49 
 
 
1804 aa  82.4  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  30.75 
 
 
1349 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  30.75 
 
 
1349 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  51.4 
 
 
943 aa  82  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  30.9 
 
 
928 aa  82  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24 
 
 
1805 aa  81.6  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  30.8 
 
 
1193 aa  81.3  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  23.46 
 
 
2303 aa  81.3  0.00000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.82 
 
 
1468 aa  80.9  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1734  ATPase-like protein  28.72 
 
 
977 aa  80.9  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.26 
 
 
1797 aa  80.1  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  29.31 
 
 
967 aa  79.7  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  30.45 
 
 
983 aa  80.1  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  29.01 
 
 
1216 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.13 
 
 
1942 aa  79  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  29.36 
 
 
1788 aa  79  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.54 
 
 
1780 aa  78.6  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.34 
 
 
1081 aa  78.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  23.19 
 
 
1774 aa  78.6  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  26.73 
 
 
1739 aa  77.8  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25 
 
 
1795 aa  77.4  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  29.96 
 
 
1043 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  57.53 
 
 
1137 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.6 
 
 
1089 aa  77.4  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  24.77 
 
 
2051 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  24.18 
 
 
1271 aa  76.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  30.36 
 
 
959 aa  76.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  56.34 
 
 
882 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  31.99 
 
 
927 aa  75.5  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  32.43 
 
 
1198 aa  75.9  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  29.31 
 
 
1160 aa  75.1  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  41.78 
 
 
932 aa  75.5  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  29.21 
 
 
956 aa  74.7  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1619  Tetratricopeptide TPR_4  33.92 
 
 
855 aa  75.1  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0543738  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  24.76 
 
 
1809 aa  75.1  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1270  LuxR family transcriptional regulator  40.69 
 
 
421 aa  74.3  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582862 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.05 
 
 
1087 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0102  serine/threonine protein kinase  30.85 
 
 
1289 aa  73.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  27.35 
 
 
1264 aa  73.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  31.76 
 
 
1064 aa  73.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  31.82 
 
 
957 aa  73.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  30.66 
 
 
1353 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  24.44 
 
 
1093 aa  72.8  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  31.25 
 
 
1132 aa  72.4  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  32.93 
 
 
981 aa  72.8  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  29.38 
 
 
1685 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  27.96 
 
 
1139 aa  72.4  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  29.86 
 
 
1685 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>