More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0442 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0442  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
546 aa  1079    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172382  decreased coverage  0.00489815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.28 
 
 
536 aa  477  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.894837  normal  0.430514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4358  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.35 
 
 
549 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.124731 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5421  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.83 
 
 
546 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5332  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.83 
 
 
546 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.7188  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5711  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.01 
 
 
546 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  46.67 
 
 
552 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11076  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.07 
 
 
543 aa  464  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0440642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3973  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.24 
 
 
545 aa  464  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.16 
 
 
543 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102582  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.16 
 
 
543 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.894285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3248  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.16 
 
 
543 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2552  AMP-dependent synthetase and ligase  44.28 
 
 
575 aa  455  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8848  AMP-dependent synthetase and ligase  44.88 
 
 
541 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0328  AMP-dependent synthetase and ligase  43.1 
 
 
540 aa  424  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3348  AMP-dependent synthetase and ligase  42.75 
 
 
542 aa  419  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4589  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.79 
 
 
538 aa  412  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.335072  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0444  AMP-dependent synthetase and ligase  41.04 
 
 
542 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3649  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.32 
 
 
537 aa  395  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1579  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.32 
 
 
537 aa  395  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000333435  normal  0.0479837 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  38.94 
 
 
537 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000368323  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3421  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.13 
 
 
537 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000306697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3382  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.13 
 
 
537 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000971977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3332  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.13 
 
 
537 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000121528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3690  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.13 
 
 
537 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3641  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.13 
 
 
537 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3660  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.32 
 
 
537 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00222723  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3738  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.13 
 
 
537 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739742  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1228  AMP-dependent synthetase and ligase  41.2 
 
 
540 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2335  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.88 
 
 
546 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2296  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.88 
 
 
546 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2108  AMP-dependent synthetase and ligase  40.34 
 
 
539 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1825  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.51 
 
 
584 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.754963  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  40.11 
 
 
543 aa  385  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2141  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.38 
 
 
589 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  40.67 
 
 
544 aa  383  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.513748  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1439  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.88 
 
 
544 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.64772  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3283  AMP-dependent synthetase and ligase  40.94 
 
 
553 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5208  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.26 
 
 
547 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.592335 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1930  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.88 
 
 
544 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.641249  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1203  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.88 
 
 
544 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1895  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.28 
 
 
547 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.88 
 
 
544 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2273  AMP-dependent synthetase and ligase  40.08 
 
 
533 aa  378  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4187  AMP-dependent synthetase and ligase  39.81 
 
 
545 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554867  normal  0.517417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1585  AMP-dependent synthetase and ligase  40.59 
 
 
549 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1930  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.08 
 
 
547 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.049446  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6172  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.01 
 
 
569 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489705  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1769  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.45 
 
 
558 aa  377  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00212051 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1907  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.01 
 
 
569 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.45334  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1367  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.42 
 
 
547 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0878998  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2275  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.33 
 
 
562 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0961938  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5439  medium-chain-fatty-acid-CoA ligase  38.59 
 
 
545 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0905  AMP-dependent synthetase and ligase  41.76 
 
 
547 aa  375  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1749  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.26 
 
 
542 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0360029  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2456  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.72 
 
 
548 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0799  putative acyl-CoA synthetase  37.66 
 
 
546 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0930157  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1316  AMP-dependent synthetase and ligase  41.85 
 
 
546 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561388  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2393  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.96 
 
 
542 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0010153  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2549  AMP-dependent synthetase and ligase  40.78 
 
 
550 aa  369  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.798559 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1925  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.14 
 
 
561 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113828  normal  0.439232 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0224  AMP-dependent synthetase and ligase  42.59 
 
 
549 aa  367  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0391267  normal  0.0314439 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0437  AMP-dependent synthetase and ligase  38.13 
 
 
547 aa  369  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0809367  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1398  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.44 
 
 
541 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0235  AMP-dependent synthetase and ligase  42.8 
 
 
538 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1863  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.56 
 
 
534 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856558  normal  0.360106 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2171  AMP-dependent synthetase and ligase  39.3 
 
 
546 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4824  AMP-dependent synthetase and ligase  39.49 
 
 
551 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal  0.874224 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0159  AMP-dependent synthetase and ligase  39.12 
 
 
544 aa  364  2e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.109446  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2982  AMP-dependent synthetase and ligase  39.66 
 
 
537 aa  364  2e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.874572  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  39.85 
 
 
544 aa  364  3e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  41.88 
 
 
565 aa  364  3e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1027  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.45 
 
 
560 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729958  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0622  AMP-dependent synthetase and ligase  38.69 
 
 
550 aa  363  6e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49286  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3306  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.59 
 
 
545 aa  362  8e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135648  normal  0.0145757 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5172  AMP-dependent synthetase and ligase  38.43 
 
 
549 aa  362  9e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.569954  normal  0.858795 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  38.21 
 
 
546 aa  361  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2845  AMP-dependent synthetase and ligase  40.8 
 
 
540 aa  361  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1843  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.45 
 
 
556 aa  360  4e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2358  AMP-dependent synthetase and ligase  40.73 
 
 
542 aa  360  5e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.594651  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.96 
 
 
542 aa  359  7e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1455  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.32 
 
 
542 aa  358  9e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0933982  hitchhiker  0.0000905753 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2579  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.94 
 
 
542 aa  358  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76612  normal  0.235984 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  37.13 
 
 
547 aa  357  1.9999999999999998e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000420413  normal  0.904573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1799  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.94 
 
 
547 aa  356  5.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2515  AMP-dependent synthetase and ligase  41.01 
 
 
527 aa  355  8.999999999999999e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.921526 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5976  AMP-dependent synthetase and ligase  38.55 
 
 
551 aa  355  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.636472  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0212  AMP-dependent synthetase and ligase  40.71 
 
 
539 aa  355  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.240297 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1678  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.12 
 
 
545 aa  353  4e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2026  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.94 
 
 
545 aa  350  3e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0380  putative acyl-CoA synthetase  39.01 
 
 
545 aa  349  9e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1837  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.76 
 
 
541 aa  347  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0196277  normal  0.206597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  37.02 
 
 
965 aa  345  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1913  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 
549 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000707868  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0759  putative acyl-CoA synthetase  36.33 
 
 
542 aa  340  5e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153349  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2639  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.2 
 
 
480 aa  339  8e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2946  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.43 
 
 
546 aa  334  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.916006 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1180  AMP-dependent synthetase and ligase  36.85 
 
 
534 aa  334  3e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.941071  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  37.05 
 
 
533 aa  333  5e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0260985  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2630  AMP-dependent synthetase and ligase  38.53 
 
 
558 aa  332  8e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589875  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>