More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0388 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 916 aa  1695    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  42.28 
 
 		 913 aa  381  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  37.31 
 
 		 919 aa  331  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  35.97 
 
 		 928 aa  327  5e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  38.05 
 
 		 884 aa  304  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  35.72 
 
 		 920 aa  296  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  37.28 
 
 		 938 aa  279  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  35.49 
 
 		 913 aa  263  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  36.05 
 
 		 940 aa  263  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  33.68 
 
 		 928 aa  261  5.0000000000000005e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  38.84 
 
 		 904 aa  259  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  33.23 
 
 		 913 aa  258  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  33.62 
 
 		 911 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  34.26 
 
 		 925 aa  255  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  34.1 
 
 		 884 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  34.45 
 
 		 917 aa  253  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  39.48 
 
 		 915 aa  249  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  34.32 
 
 		 918 aa  249  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 950 aa  248  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  41.68 
 
 		 909 aa  242  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  34.04 
 
 		 923 aa  241  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  37.24 
 
 		 879 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  34.21 
 
 		 995 aa  231  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  31.93 
 
 		 922 aa  231  6e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  32.6 
 
 		 905 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  32.11 
 
 		 936 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  33.33 
 
 		 923 aa  219  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 919 aa  217  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  32.01 
 
 		 919 aa  217  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  32.79 
 
 		 921 aa  216  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  31.93 
 
 		 923 aa  215  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 921 aa  215  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  32.58 
 
 		 921 aa  215  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  32.08 
 
 		 919 aa  215  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  33.02 
 
 		 919 aa  214  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  32.51 
 
 		 929 aa  211  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  32.59 
 
 		 903 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  40.47 
 
 		 894 aa  200  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  37.92 
 
 		 928 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  37.12 
 
 		 946 aa  197  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  31.19 
 
 		 929 aa  196  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  32.29 
 
 		 921 aa  189  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  31.32 
 
 		 919 aa  185  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  39.02 
 
 		 940 aa  184  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 953 aa  179  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  35.41 
 
 		 930 aa  177  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  30.57 
 
 		 959 aa  172  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  39.65 
 
 		 927 aa  171  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 1000 aa  171  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  39.96 
 
 		 934 aa  169  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 937 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  38.89 
 
 		 937 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  37.25 
 
 		 929 aa  163  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  39.2 
 
 		 937 aa  163  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  38 
 
 		 955 aa  162  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 889 aa  160  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  30.32 
 
 		 910 aa  157  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  40.41 
 
 		 961 aa  157  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  34.44 
 
 		 923 aa  152  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  38.33 
 
 		 892 aa  148  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 876 aa  145  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  40.26 
 
 		 910 aa  144  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 1064 aa  143  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 881 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 881 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  28.82 
 
 		 927 aa  127  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  36.29 
 
 		 900 aa  125  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  40.98 
 
 		 977 aa  124  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  28.65 
 
 		 893 aa  124  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 997 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  32.48 
 
 		 897 aa  107  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  41.36 
 
 		 240 aa  99.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  28.46 
 
 		 953 aa  98.6  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  31.3 
 
 		 918 aa  95.9  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  44.36 
 
 		 894 aa  95.5  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  32.97 
 
 		 992 aa  92.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  37.44 
 
 		 927 aa  92.8  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  33.99 
 
 		 947 aa  90.9  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  39.23 
 
 		 189 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3369  transcriptional regulator, LuxR family  32.21 
 
 		 872 aa  85.1  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  32.13 
 
 		 954 aa  84  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  40.69 
 
 		 916 aa  81.3  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 236 aa  79.7  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 		 943 aa  79.3  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  32.81 
 
 		 1052 aa  78.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  32.14 
 
 		 983 aa  78.2  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 877 aa  77.8  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  30.28 
 
 		 947 aa  77.4  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  31.47 
 
 		 951 aa  75.5  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  25.06 
 
 		 1105 aa  74.7  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 981 aa  73.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 940 aa  72.8  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  36.27 
 
 		 998 aa  72.4  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  29.53 
 
 		 943 aa  72.8  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  27.74 
 
 		 1139 aa  72  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  26.82 
 
 		 1402 aa  72.4  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  43.02 
 
 		 835 aa  71.6  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4029  ATPase-like protein  60.71 
 
 		 758 aa  71.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00633058  normal  0.086403 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 1151 aa  71.2  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5519  serine/threonine protein kinase  26.62 
 
 		 1188 aa  68.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>