More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0384 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 
258 aa  526  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  55.38 
 
 
253 aa  275  6e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  55.87 
 
 
251 aa  268  5e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  58.57 
 
 
254 aa  265  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  52.8 
 
 
253 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  50.41 
 
 
252 aa  253  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  50.41 
 
 
252 aa  248  9e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  49.8 
 
 
257 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  52.59 
 
 
259 aa  240  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  52.44 
 
 
254 aa  235  5.0000000000000005e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  49.4 
 
 
253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  47.84 
 
 
268 aa  232  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  44.36 
 
 
270 aa  214  8e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  43.95 
 
 
251 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  43.95 
 
 
251 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  42.68 
 
 
274 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  44.22 
 
 
271 aa  184  9e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  35.37 
 
 
249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  38.49 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
241 aa  144  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  36.29 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  35.48 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  35.48 
 
 
243 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  31.98 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  35.48 
 
 
243 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  35.48 
 
 
243 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  35.48 
 
 
243 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  35.08 
 
 
243 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  34 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  34.24 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
245 aa  136  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  33.47 
 
 
244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
258 aa  132  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  30.36 
 
 
254 aa  131  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  33.73 
 
 
255 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  35.68 
 
 
272 aa  128  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  37.02 
 
 
244 aa  126  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
238 aa  124  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  34.68 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  29.44 
 
 
254 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  33.6 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  28.85 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  34.58 
 
 
252 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
237 aa  111  9e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  50.83 
 
 
377 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  28.34 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  47.66 
 
 
429 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
250 aa  109  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  28.29 
 
 
253 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  28.69 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  38.16 
 
 
284 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  28.35 
 
 
253 aa  94  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 
250 aa  93.2  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
253 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  26.69 
 
 
249 aa  89  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  33.54 
 
 
250 aa  89  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  47.12 
 
 
342 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  42.22 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  39.6 
 
 
253 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
254 aa  82  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
253 aa  82  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  39.6 
 
 
253 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  41.11 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 
251 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1629  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  31.25 
 
 
148 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651813  normal  0.0608845 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  31.05 
 
 
242 aa  77  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  39.56 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0217  transcriptional regulator, MerR family  30.15 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  39.56 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  29.55 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  28.96 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  35.92 
 
 
398 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  46.24 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  37.97 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1491  regulatory protein MerR  44.79 
 
 
326 aa  72.4  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  24.6 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  37.36 
 
 
347 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2008  transcriptional regulator, MerR family  36.17 
 
 
191 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0139  transcriptional regulator, MerR family  46.25 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  46.74 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1749  MerR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.682518  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
133 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  46.81 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0829  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  52.94 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2840  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  30.48 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>