More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0319 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
382 aa  731    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  48.26 
 
 
442 aa  173  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  47.66 
 
 
416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  46.8 
 
 
410 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.88 
 
 
586 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.74 
 
 
621 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.77 
 
 
461 aa  153  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.12 
 
 
417 aa  152  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 
435 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  45.64 
 
 
587 aa  146  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3495  signal transduction histidine kinase-like protein  31.76 
 
 
410 aa  145  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0736574  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  44.68 
 
 
402 aa  144  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  42.02 
 
 
433 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.24 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  41.74 
 
 
442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 
418 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  43.95 
 
 
463 aa  140  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 
624 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  40.69 
 
 
452 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  46.7 
 
 
580 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.23 
 
 
395 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.67 
 
 
403 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 
375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  47.44 
 
 
439 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 
428 aa  135  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 
466 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  41.74 
 
 
463 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  43.08 
 
 
429 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  36.91 
 
 
383 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 
444 aa  133  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
410 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
725 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.16 
 
 
432 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  44.74 
 
 
412 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.54 
 
 
594 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  39.66 
 
 
476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 
405 aa  126  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  38.43 
 
 
430 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  39.66 
 
 
429 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.65 
 
 
386 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
412 aa  124  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  36.1 
 
 
429 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  40 
 
 
444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  39.74 
 
 
420 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  36.43 
 
 
453 aa  119  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4819  putative PAS/PAC sensor protein  46.4 
 
 
639 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00931956 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 
454 aa  119  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  41.77 
 
 
434 aa  119  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.55 
 
 
565 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 
433 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  39.66 
 
 
489 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  36.47 
 
 
388 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 
570 aa  117  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.56 
 
 
1171 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  36.76 
 
 
434 aa  116  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
435 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
435 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 
408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.67 
 
 
433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 
343 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  40.79 
 
 
405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
445 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 
438 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2053  Fis family transcriptional regulator  45.53 
 
 
664 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0248  putative signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
470 aa  113  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  42.14 
 
 
1268 aa  113  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 
417 aa  113  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5166  putative signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 
537 aa  113  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153671  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.26 
 
 
459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.41 
 
 
2654 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  35.69 
 
 
438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2893  transcriptional regulator, Fis family  45.16 
 
 
630 aa  111  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.359739 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
576 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.68 
 
 
415 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.28 
 
 
1260 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 
431 aa  109  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257994  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  38.82 
 
 
374 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4640  putative PAS/PAC sensor protein  38.17 
 
 
427 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.74459  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
398 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  28.84 
 
 
515 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 
408 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0958  Fis family transcriptional regulator  32.37 
 
 
486 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4540  Fis family transcriptional regulator  43.8 
 
 
607 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1027  Fis family transcriptional regulator  32.37 
 
 
486 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3332  sigma54 specific transcriptional regulator with PAS/PAC sensor, Fis family  32.37 
 
 
486 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
388 aa  107  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  35.68 
 
 
237 aa  106  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 
770 aa  106  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2770  PAS sensor protein  44 
 
 
629 aa  106  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3135  Fis family transcriptional regulator  32.18 
 
 
488 aa  106  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
748 aa  106  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 
819 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2997  putative PAS/PAC sensor protein  42.74 
 
 
629 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.127618 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1060  Fis family transcriptional regulator  31.79 
 
 
486 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0887  Fis family transcriptional regulator  32.18 
 
 
488 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3227  Fis family transcriptional regulator  32.18 
 
 
488 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.539563  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>