More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0315 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0315  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  100 
 
 
698 aa  1389    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.98 
 
 
708 aa  589  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449772  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1571  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.24 
 
 
693 aa  578  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.000060483  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1532  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.84 
 
 
697 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0559  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.97 
 
 
698 aa  556  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000154535  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  48.15 
 
 
724 aa  556  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1318  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.25 
 
 
756 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0376564  decreased coverage  0.0000000122508 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.88 
 
 
734 aa  550  1e-155  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3804  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.25 
 
 
698 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00343497  decreased coverage  0.0000140841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0485  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.16 
 
 
697 aa  539  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.64 
 
 
689 aa  535  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4347  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.71 
 
 
699 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0558193  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3301  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.59 
 
 
723 aa  535  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3718  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.7 
 
 
698 aa  526  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06850  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.72 
 
 
713 aa  524  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0677  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.95 
 
 
754 aa  521  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00766403  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5584  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.84 
 
 
718 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128967  normal  0.346665 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0673  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.71 
 
 
695 aa  522  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.293047  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0672  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.9 
 
 
729 aa  519  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20415  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1626  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.77 
 
 
706 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.135098  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22560  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.01 
 
 
979 aa  512  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188991  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0819  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.23 
 
 
745 aa  511  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  48.3 
 
 
691 aa  511  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346189  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.64 
 
 
693 aa  504  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000979868  decreased coverage  0.000575313 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4745  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.27 
 
 
691 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.865957 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4657  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.27 
 
 
691 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.91 
 
 
766 aa  503  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572742  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3226  ATP-dependent DNA helicase RecQ family  48.93 
 
 
691 aa  502  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225844  hitchhiker  0.0000186089 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1612  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.46 
 
 
733 aa  501  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.644858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5950  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.69 
 
 
749 aa  501  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0569292 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0133  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.3 
 
 
714 aa  499  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.931384  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5040  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.72 
 
 
691 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26563  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1436  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44 
 
 
691 aa  497  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000631982  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1524  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.2 
 
 
712 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1126  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.16 
 
 
691 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.760992  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0447  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.65 
 
 
708 aa  491  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0452326  decreased coverage  0.00000647403 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0376  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.55 
 
 
712 aa  492  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5233  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.49 
 
 
704 aa  488  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.157625 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1091  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.02 
 
 
788 aa  477  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.305899  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18920  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.73 
 
 
762 aa  467  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275245  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0184  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  45.34 
 
 
741 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2394  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  45.72 
 
 
756 aa  459  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396069  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0827  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.4 
 
 
706 aa  461  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.493882  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1940  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.65 
 
 
706 aa  460  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187923  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4035  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.03 
 
 
679 aa  421  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000527005  normal  0.0486665 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.19 
 
 
448 aa  265  3e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.54 
 
 
602 aa  233  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.66 
 
 
590 aa  226  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.19 
 
 
1376 aa  223  9e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.53 
 
 
588 aa  223  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.3 
 
 
646 aa  222  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.57 
 
 
706 aa  214  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  36.29 
 
 
705 aa  213  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36 
 
 
705 aa  212  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.29 
 
 
705 aa  211  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.29 
 
 
705 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  36.29 
 
 
705 aa  211  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.29 
 
 
705 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36 
 
 
705 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36 
 
 
705 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.71 
 
 
705 aa  207  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.46 
 
 
607 aa  206  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.71 
 
 
705 aa  205  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1976  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.3 
 
 
602 aa  204  4e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.89 
 
 
543 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.73 
 
 
709 aa  204  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.89 
 
 
543 aa  203  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.89 
 
 
543 aa  203  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.47 
 
 
709 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.2 
 
 
709 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.74 
 
 
731 aa  200  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1171  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.31 
 
 
881 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0911  superfamily II DNA helicase  37.5 
 
 
621 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.7 
 
 
592 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.29 
 
 
708 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1542  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.04 
 
 
592 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.06 
 
 
793 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  35.16 
 
 
597 aa  197  6e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.84 
 
 
707 aa  197  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.52 
 
 
626 aa  196  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.43 
 
 
716 aa  195  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1991  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.6 
 
 
593 aa  194  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.01 
 
 
593 aa  194  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.98 
 
 
725 aa  194  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.01 
 
 
593 aa  194  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.42 
 
 
562 aa  194  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2292  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37 
 
 
645 aa  194  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00114874  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3200  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.5 
 
 
600 aa  194  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.29 
 
 
626 aa  193  9e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.59 
 
 
718 aa  193  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.4 
 
 
630 aa  193  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.14 
 
 
624 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.67 
 
 
617 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.61 
 
 
563 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2064  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.04 
 
 
729 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256854  normal  0.150426 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.87 
 
 
556 aa  191  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.35 
 
 
535 aa  191  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1335  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.04 
 
 
592 aa  191  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.764051  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.82 
 
 
736 aa  190  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.26 
 
 
641 aa  190  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000407323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>