More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0278 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  402  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  65 
 
 		 208 aa  217  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  49.4 
 
 		 204 aa  148  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 205 aa  121  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  42.63 
 
 		 203 aa  121  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  43.29 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  41.11 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 199 aa  98.6  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 200 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  36.11 
 
 		 266 aa  93.2  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 214 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 214 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  38.29 
 
 		 188 aa  91.7  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 192 aa  91.3  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  37.28 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 383 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 202 aa  89  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  37.13 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 194 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 204 aa  88.2  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 205 aa  88.6  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 187 aa  84.7  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  34.39 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  38.51 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  38.69 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1163  TetR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370888  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  37.58 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 237 aa  78.2  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1545  hypothetical protein  31.61 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  37.72 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 173 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 231 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 194 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  32.73 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5169  hypothetical protein  33.71 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27231  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  30.65 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  30.32 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>