More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0277 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0277  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 229 aa  432  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2727  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.45563  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2771  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2942  regulatory protein GntR, HTH  40 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0684718  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2757  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.578268  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4488  regulatory protein GntR HTH  40.09 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7456  regulatory protein GntR HTH  42.51 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0768739  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10597  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 240 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0011  GntR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6769  regulatory protein GntR HTH  37.11 
 
 		 261 aa  87  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2617  regulatory protein GntR HTH  36.52 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1196  regulatory protein GntR HTH  53.95 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.185208  hitchhiker  0.000709934 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0357  regulatory protein GntR HTH  34.09 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000241267  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5646  regulatory protein GntR HTH  31.18 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2087  fatty acid responsive transcription factor FadR domain protein  32.28 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30946e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2130  regulatory protein GntR HTH  31.22 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0857174  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  30 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2363  fatty acid metabolism regulator  30.67 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000339682  normal  0.326287 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2109  fatty acid metabolism regulator  30.67 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109018  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1661  fatty acid metabolism regulator  27.06 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0855025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1999  fatty acid metabolism regulator  30.67 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00814717  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  30.93 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  30.93 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.97 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.97 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  36.75 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1561  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000597737  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2218  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  37.9 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0409255  hitchhiker  0.007316 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.77 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.73 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  36 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.25 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2365  fatty acid metabolism regulator  29.45 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000203201  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 255 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  36.96 
 
 		 255 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  36.96 
 
 		 255 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2174  fatty acid metabolism regulator  32.05 
 
 		 253 aa  62  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000030216  normal  0.0239474 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  30.47 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2512  fatty acid metabolism regulator  32.43 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000912913  normal  0.579868 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0623  fatty acid metabolism regulator  34.02 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000168386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1948  fatty acid metabolism regulator  29.27 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00527579  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2244  fatty acid metabolism regulator  28.66 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0118438  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2689  fatty acid metabolism regulator  30.67 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449481  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  46.97 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01162  fatty acid metabolism regulator  29.52 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000799515  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  36.23 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2461  fatty acid metabolism transcriptional regulator FadR  29.52 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000004944  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0204  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  48.48 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.502813 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  41.1 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  46.97 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1962  fatty acid metabolism regulator  29.52 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000133841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1290  fatty acid metabolism regulator  29.52 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557847  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01172  hypothetical protein  29.52 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000480756  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2438  fatty acid metabolism regulator  29.52 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000216625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2748  fatty acid metabolism regulator  29.45 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000401699  decreased coverage  0.0000363622 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  32.97 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  34.81 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1332  fatty acid metabolism regulator  29.52 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000305633  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1674  fatty acid metabolism regulator  29.52 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000616517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1345  fatty acid metabolism regulator  29.52 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00238872  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3488  fatty acid metabolism regulator  30.49 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00186982  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  35.77 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.41 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6117  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  31.32 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  41.1 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1328  fatty acid metabolism regulator  28.83 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224704  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1943  fatty acid metabolism regulator  28.83 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0247778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1947  fatty acid metabolism regulator  28.83 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0438592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1743  fatty acid metabolism regulator  29.73 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1513  fatty acid metabolism regulator  28.83 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.127061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2003  fatty acid metabolism regulator  28.83 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  31.33 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  40 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  46.97 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2438  fatty acid metabolism regulator  30.87 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000509997  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2147  fatty acid metabolism regulator  39.19 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102966  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  40 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2885  fatty acid metabolism regulator  29.3 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  40 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0659  transcriptional regulator PdhR  33.16 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.01329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  40 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1568  fatty acid metabolism regulator  29.3 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000521117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1643  fatty acid metabolism regulator  30.2 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000083399  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  40 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  40 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03226  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  42.68 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  29.03 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3744  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.02 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  40 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  33.13 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  40 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>