151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0237 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0237  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
444 aa  901    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4889  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  54.2 
 
 
429 aa  488  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  29.03 
 
 
440 aa  152  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0115  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 
478 aa  100  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132691  normal  0.193469 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 
442 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 
417 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 
419 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 
419 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  30.73 
 
 
419 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0171  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 
468 aa  69.7  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 
419 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 
427 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.92 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  23.31 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5608  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 
427 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.959607  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6548  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.94 
 
 
490 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225542 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
431 aa  67  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 
452 aa  66.6  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.57 
 
 
434 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6532  extracellular solute-binding protein family 1  24.08 
 
 
427 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0178193 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  28.57 
 
 
413 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  28.57 
 
 
399 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 
427 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 
444 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  28 
 
 
412 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 
443 aa  64.3  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  28 
 
 
412 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  28 
 
 
412 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  21.38 
 
 
419 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 
412 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 
432 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2115  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 
432 aa  57.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.845793  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  22.99 
 
 
424 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  29.71 
 
 
435 aa  57  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 
434 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 
429 aa  56.6  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6933  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.5 
 
 
412 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0038808  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  30.36 
 
 
431 aa  55.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3858  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 
449 aa  55.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000022263  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 
425 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 
431 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  28.71 
 
 
433 aa  54.7  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 
423 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1317  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 
426 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 
434 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 
451 aa  54.3  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  28.82 
 
 
421 aa  53.9  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 
423 aa  53.5  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  31.32 
 
 
435 aa  53.5  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7218  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 
412 aa  53.5  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
427 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 
424 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.12 
 
 
428 aa  52.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0494  extracellular solute-binding protein  21 
 
 
465 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 
426 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  23.31 
 
 
424 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  29.07 
 
 
424 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 
447 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  28.74 
 
 
429 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 
419 aa  52.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 
495 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 
449 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.79 
 
 
419 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 
431 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5002  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.49 
 
 
426 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.287585  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.85 
 
 
431 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 
433 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2254  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 
432 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534892  hitchhiker  0.00235651 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1478  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.26 
 
 
439 aa  51.6  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000417686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  28.46 
 
 
416 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 
448 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1080  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 
426 aa  50.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103993 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 
432 aa  51.2  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 
454 aa  51.2  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  27.02 
 
 
430 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 
439 aa  50.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.89 
 
 
406 aa  50.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  19.79 
 
 
544 aa  50.4  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.06 
 
 
422 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 
455 aa  50.1  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  30.86 
 
 
406 aa  50.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.51 
 
 
406 aa  50.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 
431 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 
440 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 
404 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0744  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 
432 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0587531  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1115  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 
439 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000327347  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 
422 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  21.54 
 
 
468 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  26.8 
 
 
439 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 
410 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  21.82 
 
 
463 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  30.06 
 
 
424 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  21.82 
 
 
463 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  28.48 
 
 
432 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  24 
 
 
433 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  38.46 
 
 
411 aa  47.4  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>