More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0172 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
324 aa  636    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
307 aa  205  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
304 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44429  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
319 aa  186  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
435 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0699  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.36 
 
 
289 aa  185  9e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.383075  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.88 
 
 
330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0584633  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.19 
 
 
315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0566045  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0749  sugar ABC transporter, permease protein, putative  34.02 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.444567  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.98 
 
 
262 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.772214  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
289 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0438989  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
306 aa  172  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.306567  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.42 
 
 
314 aa  172  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.906597  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
427 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000129291  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.88 
 
 
301 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
301 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657903  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
296 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
309 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
294 aa  168  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558297  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
323 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3121  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
317 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.01 
 
 
312 aa  167  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301949 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
290 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.12 
 
 
296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1261  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.32 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196832  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0419  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.12 
 
 
296 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 
307 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  35.79 
 
 
307 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 
314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.453212  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.737632 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
317 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3229  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.67 
 
 
314 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 
316 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
312 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
286 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262739  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 
314 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000089983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
294 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
358 aa  160  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.463035  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
288 aa  159  5e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.967188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  33.33 
 
 
318 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.67 
 
 
328 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511246  normal  0.17987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 
288 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
292 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  35.61 
 
 
305 aa  158  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
310 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0803077  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.42 
 
 
291 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
312 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
293 aa  156  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
312 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0867066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.51 
 
 
316 aa  157  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.130846  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
293 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.13 
 
 
316 aa  156  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.264329 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
310 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369054 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.96 
 
 
328 aa  156  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.9 
 
 
301 aa  155  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415177  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
316 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.15 
 
 
320 aa  155  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.85 
 
 
320 aa  155  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.227719  normal  0.433481 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01288  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.75 
 
 
293 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2496  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.39 
 
 
311 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.49 
 
 
330 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
309 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.114297  normal  0.0929805 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1426  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.75 
 
 
293 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
300 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000378352  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 
305 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0388505  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
293 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.71913  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01299  hypothetical protein  34.75 
 
 
293 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0949  permease protein of sugar ABC transporter  34.39 
 
 
292 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688345  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
324 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156181  normal  0.0141251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
303 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.916696 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3852  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
310 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0634568 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.394829 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.565462 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
297 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28370  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.29 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.096742  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.610758  normal  0.0357706 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5689  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
310 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.568061 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  32.89 
 
 
317 aa  153  4e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
291 aa  153  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.270526 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1695  hypothetical protein  32.53 
 
 
292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
313 aa  152  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115668  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
294 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01820  permease component of ABC-type sugar transporter  30.72 
 
 
312 aa  152  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 
314 aa  152  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0144983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
293 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.102296  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1696  hypothetical protein  32.53 
 
 
292 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1521  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.36 
 
 
293 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1811  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.36 
 
 
293 aa  151  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
310 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.944367  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 
305 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1956  putative sugar ABC transporter, permease protein  33.98 
 
 
293 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.798746  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2051  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.97 
 
 
293 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
338 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.24 
 
 
319 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243677  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.21 
 
 
319 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.356013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>