186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0127 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  100 
 
 
931 aa  1859    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  40.94 
 
 
669 aa  452  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  33.84 
 
 
642 aa  301  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  32.24 
 
 
641 aa  290  7e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  31.88 
 
 
633 aa  282  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  49.38 
 
 
2914 aa  68.9  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  46.21 
 
 
1426 aa  68.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  50 
 
 
2851 aa  67  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  29.55 
 
 
446 aa  65.5  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  29.55 
 
 
446 aa  65.1  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  27.19 
 
 
518 aa  62.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  28.14 
 
 
460 aa  62.8  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  55.56 
 
 
366 aa  62  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  36.64 
 
 
470 aa  62  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  40.74 
 
 
299 aa  60.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  25.57 
 
 
524 aa  60.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  42.42 
 
 
523 aa  59.3  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  51.35 
 
 
380 aa  59.3  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2241  BclA protein  57.14 
 
 
285 aa  58.5  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  60.66 
 
 
582 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  26.96 
 
 
479 aa  58.2  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  41.84 
 
 
559 aa  57.8  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  55.38 
 
 
295 aa  57.8  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  50.65 
 
 
274 aa  57.8  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  56.52 
 
 
253 aa  57.8  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  54.41 
 
 
481 aa  57.4  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  46.27 
 
 
240 aa  57.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  54.41 
 
 
478 aa  57.4  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3593  hypothetical protein  32.43 
 
 
723 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27604  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  31.36 
 
 
861 aa  57.4  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  52.17 
 
 
451 aa  57  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  55.22 
 
 
585 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  55.56 
 
 
606 aa  56.6  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  59.7 
 
 
712 aa  56.6  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  46.27 
 
 
258 aa  56.6  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  31.16 
 
 
431 aa  56.6  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  34.52 
 
 
502 aa  57  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  54.69 
 
 
474 aa  57  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1402  Collagen triple helix repeat protein  47.25 
 
 
190 aa  57  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  46.59 
 
 
437 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  56.72 
 
 
643 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  54.41 
 
 
347 aa  56.2  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  54.41 
 
 
347 aa  56.2  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  46.59 
 
 
437 aa  56.2  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  48.72 
 
 
439 aa  56.2  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  48.72 
 
 
437 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  55.71 
 
 
813 aa  55.1  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  52.17 
 
 
445 aa  55.1  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  51.43 
 
 
582 aa  55.1  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  52.17 
 
 
434 aa  55.1  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  54.67 
 
 
348 aa  55.1  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  25 
 
 
444 aa  54.7  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  41.43 
 
 
689 aa  54.7  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2201  exosporium protein H  58.33 
 
 
428 aa  54.7  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  52.05 
 
 
468 aa  54.3  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  51.43 
 
 
587 aa  53.9  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  48.57 
 
 
400 aa  53.9  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  54.69 
 
 
842 aa  54.3  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  23.01 
 
 
530 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  42.11 
 
 
814 aa  53.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  56.06 
 
 
835 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1075  Alkaline phosphatase  44.55 
 
 
635 aa  53.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4355  triple helix repeat-containing collagen  53.52 
 
 
369 aa  53.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.105642  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  55.1 
 
 
1916 aa  53.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  53.52 
 
 
426 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  40.82 
 
 
436 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1720  Collagen triple helix repeat protein  38.71 
 
 
558 aa  52.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  0.0315117 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  25 
 
 
447 aa  52.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  41.54 
 
 
552 aa  52.4  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  48.72 
 
 
645 aa  52.4  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  46.97 
 
 
580 aa  52  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  52.94 
 
 
492 aa  52  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  54.41 
 
 
288 aa  52  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  46.91 
 
 
438 aa  52  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  59.7 
 
 
512 aa  51.6  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  24.58 
 
 
444 aa  51.6  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  33.33 
 
 
252 aa  51.6  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  52.24 
 
 
466 aa  51.2  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  47.06 
 
 
390 aa  50.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  54.41 
 
 
1101 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  38.82 
 
 
382 aa  51.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  54.55 
 
 
706 aa  51.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  25 
 
 
649 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  34.71 
 
 
644 aa  50.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  45.61 
 
 
734 aa  50.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  20.76 
 
 
443 aa  50.8  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  42.86 
 
 
542 aa  50.8  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2472  triple helix repeat-containing collagen  31.68 
 
 
183 aa  50.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  52.78 
 
 
493 aa  50.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  35 
 
 
932 aa  50.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  28.8 
 
 
448 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  54.29 
 
 
459 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4079  BclA protein  58.18 
 
 
314 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  55.22 
 
 
1147 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  51.47 
 
 
1055 aa  49.3  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  50 
 
 
442 aa  49.7  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2467  exosporium protein H  55.56 
 
 
437 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  33.9 
 
 
455 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4639  collagen triple helix repeat domain protein  55.77 
 
 
360 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
522 aa  49.3  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>