117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0091 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0091  Carotenoid oxygenase  100 
 
 
477 aa  966    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.848261  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1036  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase  49.04 
 
 
470 aa  476  1e-133  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4862  Beta-carotene 15,15'-monooxygenase  49.06 
 
 
470 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169022  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4083  Carotenoid oxygenase  41.3 
 
 
472 aa  318  1e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01704  dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14410)  28.08 
 
 
575 aa  195  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.108285 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0248  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  29.42 
 
 
489 aa  187  4e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5459  Carotenoid oxygenase  30.4 
 
 
514 aa  186  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176097  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1236  retinal pigment epithelial membrane protein  29.64 
 
 
510 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229916  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0203  carotenoid oxygenase  31.3 
 
 
464 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0221  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  28.34 
 
 
488 aa  176  7e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25111  retinal pigment epithelial membrane protein  29.34 
 
 
507 aa  174  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0196  Beta-carotene 15,15'-dioxygenase  28.93 
 
 
493 aa  170  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3212  carotenoid oxygenase  26.14 
 
 
489 aa  165  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415925  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0282  retinal pigment epithelial membrane protein  26.12 
 
 
494 aa  164  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0182948  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03041  retinal pigment epithelial membrane protein  26.19 
 
 
494 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3688  carotenoid oxygenase  26.88 
 
 
485 aa  161  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1646  retinal pigment epithelial membrane protein  25.2 
 
 
497 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03071  retinal pigment epithelial membrane protein  25.51 
 
 
495 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03601  retinal pigment epithelial membrane protein  25.2 
 
 
497 aa  160  6e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03031  retinal pigment epithelial membrane protein  26.43 
 
 
494 aa  159  8e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4340  Carotenoid oxygenase  26.79 
 
 
495 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2168  retinal pigment epithelial membrane protein  26.92 
 
 
472 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.123356 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4402  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  26.59 
 
 
495 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371573 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2047  retinal pigment epithelial membrane protein  28.95 
 
 
765 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211058  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4222  Carotenoid oxygenase  29.65 
 
 
501 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0865656 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0359  Carotenoid oxygenase  25.65 
 
 
487 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.235865  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3417  dioxygenase, putative  29.31 
 
 
509 aa  149  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2446  twin-arginine translocation pathway signal  27.35 
 
 
517 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000341259  normal  0.858746 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0352  Carotenoid oxygenase  25.22 
 
 
487 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0611  carotenoid oxygenase  27.4 
 
 
481 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03131  retinal pigment epithelial membrane protein  24.69 
 
 
495 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.608355  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5644  carotenoid oxygenase  30.96 
 
 
478 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.427984 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3964  Carotenoid oxygenase  29.28 
 
 
486 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99286  normal  0.591573 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0013  Carotenoid oxygenase  24.94 
 
 
468 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0015  Carotenoid oxygenase  24.94 
 
 
468 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0449  Carotenoid oxygenase  24.9 
 
 
491 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1216  carotenoid oxygenase  31.03 
 
 
467 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5477  putative carotenoid oxygenase  32.26 
 
 
467 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3710  retinal pigment epithelial membrane protein  27.25 
 
 
463 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05214  dioxygenase signal peptide protein  27.69 
 
 
520 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2946  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  28.39 
 
 
473 aa  134  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000652034  hitchhiker  0.000168571 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1317  carotenoid oxygenase  31.57 
 
 
467 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1401  Carotenoid oxygenase  29.96 
 
 
467 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4595  carotenoid oxygenase  29.43 
 
 
479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10667  dioxygenase  26.93 
 
 
501 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.181912  normal  0.435726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4841  Carotenoid oxygenase  26.43 
 
 
464 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.659326 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3944  Carotenoid oxygenase  30.06 
 
 
481 aa  130  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0441  carotenoid oxygenase  27.86 
 
 
460 aa  130  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786971  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1535  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  28.18 
 
 
483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194369  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0281  carotenoid oxygenase  28.51 
 
 
445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.772775  hitchhiker  0.000581153 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3052  carotenoid oxygenase  24.53 
 
 
515 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1272  carotenoid oxygenase  28.72 
 
 
487 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261404  hitchhiker  0.00803245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0935  Carotenoid oxygenase  24.38 
 
 
488 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3359  carotenoid oxygenase  27.38 
 
 
502 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5321  Carotenoid oxygenase  23.88 
 
 
477 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3399  retinal pigment epithelial membrane protein  29.25 
 
 
443 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0219  carotenoid oxygenase  30.98 
 
 
445 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3919  Carotenoid oxygenase  27.63 
 
 
508 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4033  Carotenoid oxygenase  27.63 
 
 
508 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804116  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2806  carotenoid oxygenase  28.09 
 
 
445 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0300  carotenoid oxygenase  28.09 
 
 
445 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0227  carotenoid oxygenase  30.34 
 
 
445 aa  123  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205038 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5950  crocetin dialdehyde  27.48 
 
 
488 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2656  carotenoid oxygenase  26.11 
 
 
477 aa  120  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48352  predicted protein  25.1 
 
 
551 aa  119  9e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2111  carotenoid oxygenase  29.02 
 
 
480 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3058  carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase, putative  29.22 
 
 
443 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1562  putative dioxygenase  29.22 
 
 
443 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1233  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  29.22 
 
 
443 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0130033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0635  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  29.22 
 
 
443 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1459  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  29.22 
 
 
443 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0518  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  29.22 
 
 
443 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615695  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1536  carotenoid oxygenase  29.83 
 
 
467 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0771367  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1698  carotenoid oxygenase  28.75 
 
 
480 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.459113  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1428  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  29.16 
 
 
443 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1288  carotenoid oxygenase  28.95 
 
 
554 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.528505  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1244  carotenoid oxygenase  28.45 
 
 
556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0442261  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3066  Carotenoid oxygenase  27.35 
 
 
558 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.061004  hitchhiker  0.0000000132751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3952  Carotenoid oxygenase  26.47 
 
 
499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273513  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5235  carotenoid oxygenase  27.79 
 
 
451 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4867  carotenoid oxygenase  28.21 
 
 
451 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4956  carotenoid oxygenase  28.21 
 
 
451 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1322  carotenoid oxygenase  28.95 
 
 
556 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487019 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28795  predicted protein  24.49 
 
 
556 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.813535  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5723  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  27.62 
 
 
441 aa  110  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00560936  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3794  carotenoid oxygenase  25.47 
 
 
464 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0662225  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6035  carotenoid oxygenase  28.96 
 
 
479 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.96012  normal  0.0939223 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4053  Carotenoid oxygenase  27.47 
 
 
466 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3118  carotenoid oxygenase  27.81 
 
 
496 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704266  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  24.42 
 
 
914 aa  105  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3098  carotenoid oxygenase  27.81 
 
 
496 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3158  carotenoid oxygenase  27.81 
 
 
496 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.350488 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5460  carotenoid oxygenase  27.94 
 
 
459 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.645484 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1332  carotenoid oxygenase  26.96 
 
 
444 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.447717 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48408  predicted protein  26.29 
 
 
577 aa  102  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2824  carotenoid oxygenase  25.79 
 
 
504 aa  101  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2484  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  28.28 
 
 
461 aa  100  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.217647  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1008  carotenoid oxygenase  24.13 
 
 
498 aa  99.4  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0158946  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30717  predicted protein  24.02 
 
 
533 aa  92.4  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.990452 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3580  carotenoid oxygenase  27.58 
 
 
469 aa  92.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>