More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0046 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
244 aa  462  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  59.7 
 
 
207 aa  161  8e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  55.47 
 
 
196 aa  158  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  56.91 
 
 
217 aa  155  5e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  57.58 
 
 
206 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  62.71 
 
 
261 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  53.17 
 
 
235 aa  148  1e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 
239 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 
239 aa  145  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  54.05 
 
 
199 aa  145  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 
239 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  58.41 
 
 
280 aa  145  7e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.67564e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  51.56 
 
 
189 aa  145  7e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 
228 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  50 
 
 
239 aa  143  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  54.03 
 
 
212 aa  142  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  54.55 
 
 
206 aa  142  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 
251 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 
251 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  58.54 
 
 
234 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 
251 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  52.42 
 
 
226 aa  142  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  46.15 
 
 
263 aa  141  8e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  46.36 
 
 
211 aa  139  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  53.23 
 
 
249 aa  139  4e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  54.84 
 
 
245 aa  139  5e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  50.36 
 
 
297 aa  138  9e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  49.24 
 
 
204 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  49.25 
 
 
191 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  50.36 
 
 
297 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  49.61 
 
 
188 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  50.76 
 
 
198 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  4.27479e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  54.03 
 
 
299 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  52.38 
 
 
203 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  5.18233e-15  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  53.12 
 
 
247 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  48.48 
 
 
204 aa  135  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  54.03 
 
 
243 aa  136  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  55.56 
 
 
237 aa  135  7e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  51.18 
 
 
202 aa  134  1e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  45.38 
 
 
273 aa  133  2e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  51.28 
 
 
174 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  53.91 
 
 
197 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  46.15 
 
 
305 aa  132  4e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  53.91 
 
 
197 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  58.2 
 
 
208 aa  132  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  57.5 
 
 
291 aa  132  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  53.91 
 
 
218 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  53.12 
 
 
224 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  58.68 
 
 
217 aa  131  1e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  54.7 
 
 
326 aa  131  1e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  53.17 
 
 
304 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  55.86 
 
 
362 aa  129  4e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  52.38 
 
 
195 aa  129  4e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  51.61 
 
 
328 aa  129  5e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  53.51 
 
 
362 aa  128  9e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  60.87 
 
 
201 aa  128  9e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  44 
 
 
146 aa  127  1e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  54.31 
 
 
218 aa  128  1e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  53.1 
 
 
233 aa  127  1e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  50.86 
 
 
438 aa  127  2e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  46.34 
 
 
281 aa  127  2e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  1.00876e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  48.09 
 
 
204 aa  127  2e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  54.62 
 
 
368 aa  126  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  52.68 
 
 
283 aa  126  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  45.07 
 
 
216 aa  125  4e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  52.94 
 
 
329 aa  125  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0406  Lytic transglycosylase catalytic  58.77 
 
 
258 aa  124  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  0.0556667 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  54.4 
 
 
327 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  46.88 
 
 
198 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  2.86118e-10 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  47.83 
 
 
241 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 
245 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  44 
 
 
251 aa  122  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  44.12 
 
 
260 aa  122  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  37.44 
 
 
258 aa  122  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  49.21 
 
 
222 aa  120  1e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  52.8 
 
 
318 aa  121  1e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  50.43 
 
 
217 aa  120  1e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  50.41 
 
 
442 aa  120  2e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  47.13 
 
 
325 aa  120  2e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  47.15 
 
 
196 aa  120  2e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  46.34 
 
 
260 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  54.05 
 
 
354 aa  119  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  50.88 
 
 
300 aa  118  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  43.17 
 
 
208 aa  117  1e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  51.09 
 
 
296 aa  117  1e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  51.09 
 
 
296 aa  117  2e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  55.86 
 
 
215 aa  117  2e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  51.45 
 
 
285 aa  117  2e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  50.42 
 
 
202 aa  117  2e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2210  lytic transglycosylase, catalytic  58.04 
 
 
218 aa  116  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  53.85 
 
 
256 aa  116  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  43.97 
 
 
261 aa  115  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  2.65036e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  43.97 
 
 
261 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  2.81259e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  43.97 
 
 
261 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  50 
 
 
214 aa  115  7e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  50.43 
 
 
282 aa  115  7e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  54.13 
 
 
242 aa  115  7e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  52.89 
 
 
209 aa  115  8e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  43.1 
 
 
261 aa  115  8e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  51.69 
 
 
203 aa  114  1e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>