40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3220 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  100 
 
 		 204 aa  417  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0774  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  59.71 
 
 		 206 aa  248  4e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0227  CRISPR-associated Cas4 family protein  56.94 
 
 		 209 aa  238  4e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.279714  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6022  CRISPR-associated protein Cas4  44.95 
 
 		 195 aa  176  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0637  CRISPR-associated Cas4 family protein  44.68 
 
 		 191 aa  175  5e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.042721  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15190  CRISPR-associated protein Cas4  44.21 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1076  CRISPR-associated Cas4 family protein  43.98 
 
 		 197 aa  161  7e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.53 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.41 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1765  CRISPR-associated protein Cas4  26.74 
 
 		 189 aa  62  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.66 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.75 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.61 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5083  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.56 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.77 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  23.59 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1142  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.11 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.142818  hitchhiker  0.00000342837 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  23.83 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1015  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.28 
 
 		 186 aa  51.6  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  24.87 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  24.87 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  28.47 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.39 
 
 		 172 aa  51.2  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  25 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  24.88 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  23.96 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  25.25 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  25.26 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  19.68 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1816  hypothetical protein  24.79 
 
 		 170 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.08 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  20.83 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  27.69 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  26.56 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  23.45 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  21.26 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  25.25 
 
 		 559 aa  42.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1930  hypothetical protein  26 
 
 		 272 aa  42  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1277  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  23.96 
 
 		 189 aa  42  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0341356 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1121  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.46 
 
 		 190 aa  41.2  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00306765  normal  0.769752 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>