104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3187 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3187  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 140 aa  282  8e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00310168  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2285  anti-sigma F factor  32.98 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1745  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.73 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0119  anti-sigma F factor  30.85 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0401  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.44 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2901  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00340315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  26.02 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  25.2 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0030  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.06 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  25.2 
 
 		 160 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1160  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.620968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  25.2 
 
 		 160 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1662  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.98 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.503488  normal  0.167313 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  24.39 
 
 		 160 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  24.39 
 
 		 160 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  24.39 
 
 		 160 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  24.39 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  24.39 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2306  anti-sigma F factor  27.64 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2021  anti-sigma F factor  27.64 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0373  anti-sigma F factor  26.23 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1104  anti-sigma F factor  26.77 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.860331  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  21.95 
 
 		 249 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2251  anti-sigma F factor  22.95 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4100  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  21.62 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39959  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3487  serine-protein kinase RsbW  29.59 
 
 		 162 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  27.59 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4212  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.35 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.797188  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6981  histidine kinase  28.32 
 
 		 389 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.69549  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4143  anti-sigma F factor  21.48 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3984  anti-sigma F factor  21.48 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3814  anti-sigma F factor  21.48 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3830  anti-sigma F factor  21.48 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4295  anti-sigma F factor  21.48 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1623  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3904  anti-sigma F factor  21.48 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4206  anti-sigma F factor  21.48 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000134887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4183  anti-sigma F factor  20.74 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0790038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1055  anti-sigma F factor  20.74 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0411626 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4095  anti-sigma F factor  21.48 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69426e-22 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0681  sensory box histidine kinase  32.69 
 
 		 356 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393599  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1678  serine-protein kinase RsbW  29.7 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2772  anti-sigma F factor  22.13 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1570  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.55 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1593  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.55 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.395262  normal  0.322925 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1323  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  23.36 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105677  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  24.44 
 
 		 321 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0477  anti-sigma F factor  28.26 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.899963  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2065  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.2 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1497  anti-sigma F factor  27.66 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.91 
 
 		 391 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405521  normal  0.0184903 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1558  anti-sigma F factor  26.32 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  23.71 
 
 		 250 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4415  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  24.64 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00721125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2323  histidine kinase  32.73 
 
 		 328 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0514446  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3675  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  22.56 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.709341  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0862  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.84 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2820  histidine kinase  23.58 
 
 		 265 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0065  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.459983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0837  sensor histidine kinase  30.53 
 
 		 336 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0398077  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1452  hypothetical protein  26.61 
 
 		 777 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0334  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  24.17 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 399 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3724  ATPase domain-containing protein  28.26 
 
 		 163 aa  42  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2035  putative photosynthetic apparatus regulatory protein regB  30.09 
 
 		 450 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.83 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  24.07 
 
 		 537 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1964  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 427 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  normal  0.092514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2113  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  17.56 
 
 		 137 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7100  signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 357 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2515  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538602  normal  0.204677 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1869  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 553 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3441  anti-sigma F factor  26.04 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 374 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3500  anti-sigma regulatory factor  28.79 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1235  sensor histidine kinase  28.83 
 
 		 353 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000222357  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2469  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  23.08 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4977  sensor histidine kinase  33.65 
 
 		 340 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07010  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4588  sensor histidine kinase  33.65 
 
 		 340 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.868097  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 332 aa  40.4  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0731  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.42 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.993652  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2468  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.21 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0214018  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2650  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 		 141 aa  40.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  27.78 
 
 		 466 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  27.78 
 
 		 466 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1102  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 		 364 aa  40.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1584  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 		 141 aa  40.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4990  sensor histidine kinase  33.65 
 
 		 340 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1357  sensor histidine kinase  27.93 
 
 		 396 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4726  sensor histidine kinase  33.65 
 
 		 340 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5088  sensor histidine kinase  33.65 
 
 		 340 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4962  sensor histidine kinase  33.65 
 
 		 340 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0271  sensor histidine kinase  33.65 
 
 		 340 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4949  sensor histidine kinase  33.65 
 
 		 340 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 654 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  26.12 
 
 		 342 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1875  anti-sigma regulatory factor  26.74 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 403 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4678  histidine kinase  33.65 
 
 		 340 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>