More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3170 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3170  ABC transporter related protein  100 
 
 		 217 aa  447  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0178954  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  62.75 
 
 		 293 aa  271  5.000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0941  ATP binding protein of ABC transporter  63.18 
 
 		 218 aa  271  5.000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000194458  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  60.7 
 
 		 251 aa  264  7e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  58.05 
 
 		 240 aa  255  4e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  58.71 
 
 		 238 aa  248  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  54.23 
 
 		 237 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  50.98 
 
 		 239 aa  221  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  48.54 
 
 		 241 aa  220  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  48.36 
 
 		 234 aa  215  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  48.36 
 
 		 234 aa  215  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  52.28 
 
 		 221 aa  214  7e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  45.19 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  47 
 
 		 241 aa  209  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  49.75 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  50.25 
 
 		 248 aa  208  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  50.25 
 
 		 225 aa  207  8e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  50.25 
 
 		 225 aa  207  8e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  48.06 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  50.98 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  47 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  50.25 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  47.5 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  50.75 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  48.26 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  48.04 
 
 		 286 aa  206  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  47.5 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  48.76 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  48.5 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  47.24 
 
 		 230 aa  205  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  47.76 
 
 		 256 aa  205  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  47 
 
 		 236 aa  205  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  49 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  46 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  46 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  48 
 
 		 266 aa  204  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  48.26 
 
 		 248 aa  204  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  48.26 
 
 		 248 aa  204  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  50 
 
 		 239 aa  204  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  46 
 
 		 240 aa  204  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  50 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  47.5 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  49 
 
 		 225 aa  202  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  47.5 
 
 		 445 aa  202  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  48.76 
 
 		 256 aa  202  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  49.25 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  46.27 
 
 		 260 aa  202  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  47.55 
 
 		 319 aa  202  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  42.65 
 
 		 249 aa  202  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  47.24 
 
 		 661 aa  202  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  46.6 
 
 		 228 aa  202  4e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  47.26 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  45.81 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  41.4 
 
 		 244 aa  201  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0238  ABC transporter related  47.03 
 
 		 223 aa  201  6e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.145385 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  46.27 
 
 		 236 aa  201  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  47.14 
 
 		 293 aa  201  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  43.84 
 
 		 249 aa  201  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  48.24 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  47 
 
 		 254 aa  201  7e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  46.83 
 
 		 225 aa  201  9e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  48.76 
 
 		 229 aa  201  9e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  45.85 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5234  ABC transporter ATP-binding protein  46.73 
 
 		 237 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  44.5 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  47.24 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  50 
 
 		 277 aa  200  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  48.5 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  50.25 
 
 		 642 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  47.74 
 
 		 232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.78 
 
 		 280 aa  199  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  47 
 
 		 238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  47.5 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  49.5 
 
 		 241 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  47.76 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  47.06 
 
 		 229 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  49.26 
 
 		 228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  47.5 
 
 		 217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  46.77 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  45.32 
 
 		 255 aa  198  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  46.38 
 
 		 236 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  45.37 
 
 		 233 aa  198  3.9999999999999996e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  47 
 
 		 230 aa  198  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  47.5 
 
 		 236 aa  198  6e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  47.5 
 
 		 246 aa  198  6e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 		 246 aa  198  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  49.75 
 
 		 229 aa  198  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  45.1 
 
 		 228 aa  197  7e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  47.55 
 
 		 227 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  45 
 
 		 259 aa  197  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  49.01 
 
 		 228 aa  197  9e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  49.26 
 
 		 225 aa  197  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0282  ABC transporter, ATP-binding protein  46.97 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  47 
 
 		 455 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4456  ABC transporter related protein  48.76 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2966  ABC transporter-like protein  48.47 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3983  ABC transporter related  44.72 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.37 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  47.26 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>