180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3117 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  100 
 
 		 251 aa  489  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  50.62 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  45.6 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  46.09 
 
 		 245 aa  182  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  46.09 
 
 		 245 aa  182  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  44.22 
 
 		 261 aa  182  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  41.7 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  41.7 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  42.26 
 
 		 304 aa  174  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  42.92 
 
 		 309 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  41.6 
 
 		 260 aa  171  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  41.6 
 
 		 260 aa  171  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  42.86 
 
 		 246 aa  171  7.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  39.27 
 
 		 271 aa  168  7e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  42.42 
 
 		 261 aa  168  7e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  39.84 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  38.19 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  41.28 
 
 		 300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  39.23 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  39.02 
 
 		 272 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  38.17 
 
 		 272 aa  164  9e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  39.38 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  39.75 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  40.85 
 
 		 306 aa  161  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  39.2 
 
 		 271 aa  160  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  38.8 
 
 		 270 aa  158  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  40.16 
 
 		 305 aa  158  7e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  38.11 
 
 		 308 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  39.18 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  38.52 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  37.2 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  39.13 
 
 		 258 aa  155  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  35.65 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  35.74 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  38.79 
 
 		 309 aa  151  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1781  zinc/iron permease  41.46 
 
 		 284 aa  151  8.999999999999999e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.080702 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  34.1 
 
 		 269 aa  149  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  37.45 
 
 		 268 aa  149  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  35.86 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  37.35 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  37.14 
 
 		 312 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  36.4 
 
 		 270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  38.8 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  34.73 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  37.14 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  40.6 
 
 		 300 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  36.33 
 
 		 250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  37.75 
 
 		 270 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  36.73 
 
 		 312 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  37.35 
 
 		 300 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  34.68 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  38.06 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  35 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  34.01 
 
 		 269 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  37.86 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  38.27 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  36.21 
 
 		 317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  36.29 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  37.19 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  37.19 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  36.25 
 
 		 264 aa  135  9e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57990  hypothetical protein  36.33 
 
 		 310 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  34.41 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  35.86 
 
 		 276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0852  Zinc transporter ZIP  39.92 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  35.07 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0870  zinc/iron permease  28.47 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  37.76 
 
 		 247 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  31.3 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  31.17 
 
 		 268 aa  108  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  31.56 
 
 		 267 aa  108  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  32.26 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  32.91 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  31.8 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  34.74 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  29.69 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  30.43 
 
 		 277 aa  99.8  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  28.51 
 
 		 247 aa  99.4  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  30.07 
 
 		 298 aa  99  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  29.64 
 
 		 272 aa  98.6  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0717  zinc transporter ZupT  30.98 
 
 		 279 aa  95.5  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000126072  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  30.68 
 
 		 253 aa  95.5  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  29.37 
 
 		 265 aa  95.5  8e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0009  zinc/iron permease  35.09 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.288224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0305  zinc/iron permease  31.91 
 
 		 244 aa  94.4  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0694906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  29.08 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  30.28 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  30.28 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  30.28 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  30.28 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  31.51 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  30.28 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  30.28 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  30.28 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  30.28 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  30.15 
 
 		 275 aa  93.2  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  28.69 
 
 		 257 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  28.69 
 
 		 257 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  28.69 
 
 		 257 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  28.69 
 
 		 257 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>