More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3110 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_3110  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  100 
 
 
254 aa  516  1e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  72.8 
 
 
253 aa  389  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.72262e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0550  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  64 
 
 
254 aa  313  2e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  57.14 
 
 
244 aa  278  4e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00485508  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0064  HesA/MoeB/ThiF family protein  58.73 
 
 
253 aa  278  5e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0067  HesA/MoeB/ThiF family protein  58.73 
 
 
253 aa  278  5e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  58 
 
 
244 aa  271  7e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0002961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1368  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.98 
 
 
255 aa  265  5e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.73518e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3237  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  52.57 
 
 
255 aa  263  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0154153  normal  0.0391126 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23710  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  58.47 
 
 
258 aa  258  4e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  3.94678e-05  normal  0.987322 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3288  thiF family protein  51.39 
 
 
255 aa  259  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2198  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.61 
 
 
258 aa  241  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00658459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2029  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.41 
 
 
258 aa  237  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57166e-10 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4414  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.41 
 
 
256 aa  236  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2278  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.81 
 
 
244 aa  227  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00531511  hitchhiker  7.38809e-07 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.67 
 
 
254 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  8.13417e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0761  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.2 
 
 
246 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.78365e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3036  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.42 
 
 
258 aa  216  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06440  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  46.03 
 
 
247 aa  205  6e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.217123 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2248  HesA/MoeB/ThiF family protein  45.14 
 
 
240 aa  204  8e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1848  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3014  HesA/MoeB/thiF family protein  43.15 
 
 
252 aa  202  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7357e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1464  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.38 
 
 
242 aa  202  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1675  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  46.25 
 
 
242 aa  199  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.492542  hitchhiker  0.00106049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0946  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.43 
 
 
254 aa  195  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3117  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.43 
 
 
255 aa  194  8e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  4.96284e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4630  hesA/moeB/thiF family protein  46.25 
 
 
255 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  4.45557e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4144  hesA/moeB/thiF family protein  46.25 
 
 
255 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  2.36944e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3176  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.64 
 
 
257 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4481  hesA/moeB/thiF family protein  46.25 
 
 
255 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.6452e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4296  hesA/moeB/thiF family protein  46.25 
 
 
255 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  1.13687e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4134  hesA/moeB/thiF family protein  46.25 
 
 
255 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  8.45686e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4484  hesA/moeB/thiF family protein  46.25 
 
 
255 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  6.92664e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0522  HesA/MoeB/ThiF family protein  43.32 
 
 
267 aa  193  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4521  hesA/moeB/thiF family protein  46.25 
 
 
255 aa  193  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.82259e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4534  hesA/moeB/thiF family protein  46.25 
 
 
255 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  7.45261e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0715  hesA/moeB/thiF family protein  46.25 
 
 
255 aa  193  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  9.90791e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4248  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.25 
 
 
255 aa  192  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000534198  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.5 
 
 
253 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594436  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.02 
 
 
242 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2571  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.29 
 
 
243 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.508745  normal  0.0248599 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2263  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.37 
 
 
252 aa  175  6e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.123515  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0619  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.3 
 
 
244 aa  173  3e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.19184 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0322  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  40.82 
 
 
240 aa  172  6e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1191  HesA/MoeB/ThiF family protein  42.97 
 
 
258 aa  172  6e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.237248  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.85 
 
 
263 aa  169  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1693  HesA/MoeB/ThiF family protein  40.98 
 
 
249 aa  169  4e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.658136 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1686  hypothetical protein  40.15 
 
 
257 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  3.36589e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1719  hypothetical protein  40.15 
 
 
257 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00168619  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.63 
 
 
254 aa  166  3e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  2.51146e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.34 
 
 
246 aa  163  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1086  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.84 
 
 
246 aa  161  9e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3313  ThiF family protein  36.08 
 
 
268 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.223246  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3213  ThiF family protein  36.08 
 
 
268 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3133  ThiF family protein  36.08 
 
 
268 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.852277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3199  ThiF family protein  36.08 
 
 
268 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0813  hypothetical protein  38.65 
 
 
236 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000136128  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3150  ThiF family protein  36.08 
 
 
268 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3058  ThiF family protein  42.72 
 
 
268 aa  158  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0969752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2953  ThiF family protein  40.78 
 
 
266 aa  156  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0973303  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02624  hypothetical protein  40.78 
 
 
268 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02663  hypothetical protein  40.78 
 
 
268 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0876  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.78 
 
 
268 aa  155  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0900  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.78 
 
 
268 aa  155  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2956  ThiF family protein  40.78 
 
 
268 aa  155  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00132  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3118  ThiF family protein  40.78 
 
 
268 aa  155  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00141325  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1048  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.16 
 
 
275 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3224  hypothetical protein  35.16 
 
 
275 aa  155  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  normal  0.551633 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0996  thiF family protein  35.16 
 
 
275 aa  155  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0511396  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3809  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.63 
 
 
268 aa  154  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  5.33838e-05  hitchhiker  5.27658e-07 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.38 
 
 
272 aa  153  3e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002691  HesA/MoeB/ThiF family protein  40.29 
 
 
269 aa  152  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0923  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.61 
 
 
270 aa  152  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03292  hypothetical protein  40.29 
 
 
269 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4077  ThiF family protein  40.29 
 
 
266 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1898  HesA/MoeB/ThiF family protein  34.51 
 
 
273 aa  149  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0512  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.02 
 
 
268 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0852  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.41 
 
 
261 aa  149  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3182  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.61 
 
 
277 aa  147  1e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2998  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.61 
 
 
275 aa  147  1e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2016  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.51 
 
 
248 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4459  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.78 
 
 
259 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.35994e-07 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2386  HesA/MoeB/ThiF family protein  36.51 
 
 
248 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2212  thiF family protein  37.32 
 
 
272 aa  143  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0073  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.24 
 
 
264 aa  141  9e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000480961  normal  0.411412 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0818  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  40.91 
 
 
295 aa  140  2e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0660  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.66 
 
 
288 aa  140  2e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0996044  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1255  hypothetical protein  32.65 
 
 
255 aa  140  2e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000298288  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2495  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.66 
 
 
288 aa  140  2e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0905  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.66 
 
 
288 aa  140  2e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386795  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0108  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.66 
 
 
288 aa  140  2e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00087346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0360  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.66 
 
 
288 aa  140  2e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00356091  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2776  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.01 
 
 
237 aa  139  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.183902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1062  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.66 
 
 
341 aa  139  4e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0718  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.23 
 
 
288 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0036619  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0729  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.71 
 
 
285 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0902  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.23 
 
 
288 aa  136  3e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1574  peptide chain release factor 2  42.49 
 
 
216 aa  136  4e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4181  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.55 
 
 
259 aa  135  6e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0515522 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0515  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.76 
 
 
286 aa  135  6e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.632456  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0546  HesA/MoeB/ThiF family protein  39.23 
 
 
277 aa  135  8e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0491251  normal  0.0100346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>