More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3101 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3101  L,L-diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 410 aa  843    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2324  L,L-diaminopimelate aminotransferase  71.5 
 
 		 409 aa  629  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4564  L,L-diaminopimelate aminotransferase  72.48 
 
 		 411 aa  623  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273776  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1014  L,L-diaminopimelate aminotransferase  68.29 
 
 		 409 aa  605  9.999999999999999e-173  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3995  aminotransferase class I and II  65.59 
 
 		 411 aa  581  1.0000000000000001e-165  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2423  L,L-diaminopimelate aminotransferase  65.52 
 
 		 410 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671346  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3040  L,L-diaminopimelate aminotransferase  65.37 
 
 		 410 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3061  L,L-diaminopimelate aminotransferase  66.34 
 
 		 410 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371159  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0238  L,L-diaminopimelate aminotransferase  65.85 
 
 		 410 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0162  L,L-diaminopimelate aminotransferase  65.61 
 
 		 410 aa  566  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0213  L,L-diaminopimelate aminotransferase  65.37 
 
 		 410 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0427359  hitchhiker  0.00000000000342652 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4142  L,L-diaminopimelate aminotransferase  63.41 
 
 		 411 aa  558  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4052  L,L-diaminopimelate aminotransferase  63.41 
 
 		 411 aa  554  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0631  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.35 
 
 		 404 aa  546  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.923394  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.05 
 
 		 408 aa  541  1e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.118927  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16911  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.78 
 
 		 408 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1592  L,L-diaminopimelate aminotransferase  61.03 
 
 		 408 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.518523  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2354  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.38 
 
 		 411 aa  540  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1351  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.34 
 
 		 407 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4059  L,L-diaminopimelate aminotransferase  63.12 
 
 		 411 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1424  LL-diaminopimelate aminotransferase  61.73 
 
 		 411 aa  536  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0853  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.93 
 
 		 411 aa  533  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217772  hitchhiker  0.00920973 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0494  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.38 
 
 		 411 aa  532  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0509  L,L-diaminopimelate aminotransferase  62.38 
 
 		 411 aa  532  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3293  L,L-diaminopimelate aminotransferase  61.73 
 
 		 411 aa  531  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.792404  decreased coverage  0.00697344 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16801  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.82 
 
 		 408 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.05 
 
 		 408 aa  525  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1151  aminotransferase class I and II  59.56 
 
 		 408 aa  525  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4424  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.1 
 
 		 411 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0886982 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0704  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.41 
 
 		 407 aa  518  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167221  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4620  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.16 
 
 		 407 aa  521  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0311  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.07 
 
 		 408 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19411  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.56 
 
 		 408 aa  504  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1066  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.07 
 
 		 408 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23741  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.53 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113284 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2779  L,L-diaminopimelate aminotransferase  56.37 
 
 		 409 aa  498  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0363182  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1185  L,L-diaminopimelate aminotransferase  55.85 
 
 		 531 aa  497  1e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16221  L,L-diaminopimelate aminotransferase  56.86 
 
 		 408 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.516745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00770  LL-diaminopimelate aminotransferase  48.42 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.386201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22909  predicted protein  44.47 
 
 		 443 aa  326  6e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30412  predicted protein  42.79 
 
 		 402 aa  324  2e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00618284  normal  0.581125 
 
 
-
 
NC_002620  TC0669  L,L-diaminopimelate aminotransferase  39.11 
 
 		 393 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  31.03 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  31.49 
 
 		 390 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.02 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.94 
 
 		 387 aa  155  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.03 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.45 
 
 		 389 aa  150  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  30.94 
 
 		 389 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.63 
 
 		 390 aa  150  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  30.2 
 
 		 392 aa  149  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  30.33 
 
 		 386 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  30.69 
 
 		 401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  27.76 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.7 
 
 		 385 aa  143  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.1 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  28.47 
 
 		 391 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  26.41 
 
 		 391 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  29.82 
 
 		 384 aa  137  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  29.83 
 
 		 395 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  30.79 
 
 		 382 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.19 
 
 		 392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  26.96 
 
 		 396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  28.82 
 
 		 382 aa  133  6e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  27.6 
 
 		 388 aa  133  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  28.89 
 
 		 382 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.35 
 
 		 385 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  28.06 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  26.89 
 
 		 392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  26.63 
 
 		 392 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  29.48 
 
 		 382 aa  130  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  26.7 
 
 		 392 aa  131  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0499  transaminase  28.94 
 
 		 393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000751793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  27.39 
 
 		 392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  27.39 
 
 		 392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  27.39 
 
 		 392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  27.39 
 
 		 392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  28.44 
 
 		 392 aa  129  7.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  27.13 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  27.13 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.77 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  28.89 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  25.98 
 
 		 387 aa  126  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  26.87 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  26.62 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  26.89 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.26 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  26.91 
 
 		 391 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  26.62 
 
 		 399 aa  123  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  27.59 
 
 		 403 aa  123  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  27.54 
 
 		 391 aa  122  9e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  28.04 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  26.07 
 
 		 392 aa  121  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  28.57 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  27.48 
 
 		 388 aa  120  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  26.52 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  25.94 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  28.09 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  26.23 
 
 		 388 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  26.38 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>