More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3100 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 280 aa  573  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  71.48 
 
 		 277 aa  418  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  70.76 
 
 		 277 aa  414  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  69.68 
 
 		 277 aa  411  1e-114  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  70.04 
 
 		 292 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  60.36 
 
 		 287 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  57.4 
 
 		 304 aa  353  2e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  58.1 
 
 		 282 aa  333  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  58.21 
 
 		 278 aa  331  6e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  56.89 
 
 		 282 aa  330  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  57.71 
 
 		 278 aa  330  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  57.71 
 
 		 278 aa  329  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  57.19 
 
 		 279 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  56.99 
 
 		 278 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  57.35 
 
 		 278 aa  324  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  54.32 
 
 		 277 aa  319  3e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  52.9 
 
 		 283 aa  310  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  52.17 
 
 		 280 aa  297  1e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  53.55 
 
 		 282 aa  296  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  53.99 
 
 		 284 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  50.54 
 
 		 279 aa  291  1e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  53.41 
 
 		 279 aa  290  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  52.13 
 
 		 279 aa  284  1.0000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  47 
 
 		 284 aa  278  5e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  53.45 
 
 		 279 aa  278  5e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  51.45 
 
 		 288 aa  277  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  50.18 
 
 		 278 aa  276  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  51.09 
 
 		 288 aa  275  5e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  51.09 
 
 		 288 aa  275  5e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  51.09 
 
 		 288 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  51.09 
 
 		 288 aa  275  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  51.09 
 
 		 288 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  50.72 
 
 		 288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  51.77 
 
 		 280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  51.09 
 
 		 288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  50.36 
 
 		 288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  50.72 
 
 		 288 aa  273  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  49.64 
 
 		 281 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  50.72 
 
 		 288 aa  271  6e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  48.19 
 
 		 278 aa  267  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  47.67 
 
 		 277 aa  266  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  46.62 
 
 		 308 aa  264  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  48.24 
 
 		 281 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  45.14 
 
 		 288 aa  262  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  50.54 
 
 		 278 aa  261  6e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  48.9 
 
 		 269 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  45.49 
 
 		 288 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2888  diaminopimelate epimerase  51.81 
 
 		 284 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  47.6 
 
 		 407 aa  261  1e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  47.89 
 
 		 281 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  43.75 
 
 		 292 aa  258  8e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  44.1 
 
 		 292 aa  257  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  48.36 
 
 		 274 aa  257  1e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  47.14 
 
 		 277 aa  255  5e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  50 
 
 		 280 aa  255  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  46.04 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3033  diaminopimelate epimerase  51.09 
 
 		 290 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  44.33 
 
 		 279 aa  253  3e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  43.37 
 
 		 290 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  43.99 
 
 		 387 aa  247  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  43.17 
 
 		 281 aa  245  6.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  43.62 
 
 		 278 aa  244  8e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  43.73 
 
 		 276 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  42.76 
 
 		 309 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  41.44 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  42.56 
 
 		 289 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47710  diaminopimelate epimerase  48.57 
 
 		 276 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  41.44 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0266  diaminopimelate epimerase  47.14 
 
 		 276 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  42.76 
 
 		 289 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  42.41 
 
 		 309 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  42.41 
 
 		 309 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0899  diaminopimelate epimerase  42.09 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5289  diaminopimelate epimerase  47.67 
 
 		 276 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  41.81 
 
 		 287 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5228  diaminopimelate epimerase  47.31 
 
 		 287 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0137  diaminopimelate epimerase  44.79 
 
 		 292 aa  237  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  42.01 
 
 		 286 aa  237  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  42.01 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2542  diaminopimelate epimerase  45.16 
 
 		 277 aa  237  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  43.77 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2994  diaminopimelate epimerase  42.46 
 
 		 282 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0384566 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  42.91 
 
 		 289 aa  236  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  42.65 
 
 		 277 aa  236  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  41.94 
 
 		 274 aa  235  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5137  diaminopimelate epimerase  46.95 
 
 		 276 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.91439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  42.71 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0244  diaminopimelate epimerase  47.86 
 
 		 276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0867905  normal  0.652879 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1610  diaminopimelate epimerase  41.94 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0224  diaminopimelate epimerase  46.95 
 
 		 276 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5499  diaminopimelate epimerase  47.5 
 
 		 276 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  43.86 
 
 		 276 aa  232  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0171  Diaminopimelate epimerase  42.91 
 
 		 286 aa  231  8.000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  44.13 
 
 		 368 aa  231  9e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0183  diaminopimelate epimerase  46.95 
 
 		 276 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0799  diaminopimelate epimerase  40.75 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  41.5 
 
 		 299 aa  229  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  41.98 
 
 		 295 aa  228  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  41.64 
 
 		 274 aa  228  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  41.64 
 
 		 274 aa  228  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>