36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3089 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3089  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  263  7e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330807  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2423  UspA domain protein  63.2 
 
 		 127 aa  160  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0931  osmosensitive K+ channel histidine kinase-like protein  39.36 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3672  UspA domain-containing protein  25.81 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128034  decreased coverage  0.00271442 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1758  hypothetical protein  31.67 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1318  UspA domain-containing protein  24 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0138898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  30.53 
 
 		 910 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1729  potassium-transporting ATPase D chain  31.78 
 
 		 370 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1191  osmosensitive K+ channel histidine kinase sensor subunit  28.8 
 
 		 377 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.588152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0684  Osmosensitive K channel His kinase sensor  31.25 
 
 		 368 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0711  Osmosensitive K channel His kinase sensor  31.25 
 
 		 368 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3494  translation initiation factor IF-2  29.13 
 
 		 370 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0190  osmosensitive K+ channel histidine kinase sensor subunit  33.33 
 
 		 373 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921987  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4607  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 836 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4295  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 836 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537586  normal  0.556945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4229  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 836 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0720  Osmosensitive K channel His kinase sensor  27.08 
 
 		 643 aa  46.2  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0117692  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 892 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4719  Osmosensitive K channel His kinase sensor  27.08 
 
 		 377 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1746  Osmosensitive K channel His kinase sensor  25.49 
 
 		 553 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2290  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 		 951 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.014043  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2852  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  28 
 
 		 365 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.656775  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0508  osmosensitive K+ channel, histidine kinase sensor  23.89 
 
 		 373 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.831446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11046  two component system sensor histidine kinase kdpD  26.04 
 
 		 860 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0056  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  25.25 
 
 		 379 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  27.93 
 
 		 297 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1127  sensor protein KdpD  24.59 
 
 		 910 aa  41.6  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1680  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  22.83 
 
 		 961 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6071  two component sensor kinase  22.41 
 
 		 902 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0897  sensor histidine kinase KdpD  24.41 
 
 		 384 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.744976  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1175  osmosensitive K channel signal transduction histidine kinase, sensor subunit KdpD  24 
 
 		 389 aa  40.8  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0800  sensor histidine kinase KdpD  26.12 
 
 		 381 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.864791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0812  sensor histidine kinase KdpD  24.41 
 
 		 384 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4531  sensor histidine kinase KdpD  24.81 
 
 		 381 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.797067  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0657  osmosensitive K channel His kinase sensor  24.03 
 
 		 381 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  26 
 
 		 888 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>