More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3046 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_3046  cell cycle protein  100 
 
 
422 aa  837    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000270462  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0875  cell cycle protein  47.49 
 
 
422 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1055  cell cycle protein  43.18 
 
 
414 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000372052  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0910  cell cycle protein  38.87 
 
 
405 aa  255  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.32654  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0023  cell cycle protein  37.03 
 
 
429 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2306  cell cycle protein  38.54 
 
 
426 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.186468  hitchhiker  0.000727648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0026  cell cycle protein  39.3 
 
 
470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0339  cell cycle protein FtsW  38.12 
 
 
409 aa  242  7e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0331  cell cycle protein FtsW  37.85 
 
 
409 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2477  cell cycle protein  36.67 
 
 
399 aa  239  5e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10017  cell division protein rodA  38.04 
 
 
469 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222067  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1712  cell cycle protein  40.91 
 
 
441 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0809  cell cycle protein  39.57 
 
 
470 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3846  cell cycle protein  38.76 
 
 
428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.57616  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0018  cell cycle protein  35.71 
 
 
470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0026  cell cycle protein  35.71 
 
 
470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462099  hitchhiker  0.00956397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0018  cell cycle protein  35.71 
 
 
470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0785065  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1377  cell cycle protein  39.84 
 
 
439 aa  228  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0074  cell cycle protein  36.2 
 
 
457 aa  226  8e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3844  cell cycle protein  36.12 
 
 
443 aa  223  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.090229  hitchhiker  0.000109873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0137  cell cycle protein  36.77 
 
 
493 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882839  decreased coverage  0.000566285 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0578  cell cycle protein  36.25 
 
 
443 aa  223  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  34.95 
 
 
517 aa  222  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.545954  normal  0.347866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1306  cell cycle protein  37.44 
 
 
472 aa  219  7.999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4433  cell cycle protein  35.81 
 
 
498 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0080  cell cycle protein  38.34 
 
 
487 aa  216  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0021  cell cycle protein  34.68 
 
 
459 aa  216  9e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  38.89 
 
 
972 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0025  cell cycle protein  35.6 
 
 
468 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0044  cell cycle protein  37.66 
 
 
472 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0052  cell cycle protein  35.19 
 
 
460 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00121731  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0023  cell cycle protein  35.95 
 
 
462 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000166651 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0023  cell cycle protein  36.08 
 
 
486 aa  210  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0030  cell cycle protein  36.91 
 
 
475 aa  209  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36129  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0028  cell cycle protein  34.05 
 
 
533 aa  209  6e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1647  cell cycle protein  36.1 
 
 
480 aa  208  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393395  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.08 
 
 
954 aa  206  5e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.57 
 
 
924 aa  206  8e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0114  cell division protein FtsW  34.91 
 
 
459 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.469585  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0021  cell cycle protein  33.16 
 
 
496 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0173  cell cycle protein  34.78 
 
 
563 aa  201  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.821251 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0028  cell cycle protein  35.56 
 
 
476 aa  200  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26960  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  31.97 
 
 
463 aa  199  7.999999999999999e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.538184  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0024  cell cycle protein  36 
 
 
487 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0545169  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  33.11 
 
 
463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  36.69 
 
 
921 aa  196  5.000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  35.24 
 
 
933 aa  194  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0045  cell cycle protein  33.58 
 
 
496 aa  193  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380495  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1449  cell cycle protein  33.5 
 
 
463 aa  193  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.769758  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00780  cell division protein RodA  33.91 
 
 
474 aa  191  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0038  cell cycle protein  37.14 
 
 
473 aa  188  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1003  cell cycle protein  34.62 
 
 
444 aa  187  3e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0033  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  31.14 
 
 
493 aa  187  4e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0777  cell division protein FtsW  35.67 
 
 
361 aa  186  8e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.968195  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5249  cell cycle protein  32.71 
 
 
469 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168107 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0029  cell cycle protein  36.24 
 
 
494 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0015  cell cycle protein  38.32 
 
 
435 aa  183  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00390  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  34.39 
 
 
543 aa  182  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.476273 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  34.93 
 
 
374 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6474  cell cycle protein  30.42 
 
 
529 aa  176  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1303  cell division protein FtsW  32.43 
 
 
365 aa  175  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1380  cell division membrane protein  31.71 
 
 
519 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0050  cell cycle protein  33.33 
 
 
496 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  31.1 
 
 
368 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  34.97 
 
 
367 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  35.77 
 
 
365 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  30.56 
 
 
368 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  35.08 
 
 
371 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  34.13 
 
 
367 aa  170  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3257  cell division protein FtsW  31.81 
 
 
511 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19497  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3319  cell division protein FtsW  31.81 
 
 
511 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40135  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3524  cell division protein FtsW  35.8 
 
 
501 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.336809  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3268  cell division protein FtsW  31.81 
 
 
511 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162204  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0066  cell cycle protein  31.43 
 
 
517 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2203  cell cycle protein FtsW  31.32 
 
 
369 aa  167  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2987  cell division protein FtsW  33.61 
 
 
506 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0447497 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  33.07 
 
 
374 aa  166  9e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  32.23 
 
 
364 aa  164  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  35.23 
 
 
423 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  31.52 
 
 
359 aa  161  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2474  cell cycle protein  33.16 
 
 
376 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0036  cell cycle protein  30.69 
 
 
659 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  31.68 
 
 
509 aa  158  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1892  stage V sporulation protein E  35.41 
 
 
366 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  30.6 
 
 
375 aa  157  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2869  cell division membrane protein-like protein  31.51 
 
 
441 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488582  normal  0.643206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  33.6 
 
 
420 aa  156  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04731  cell division protein FtsW  31.95 
 
 
415 aa  156  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1229  stage V sporulation protein E  35.12 
 
 
363 aa  156  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000285067  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5099  cell division protein FtsW  29.59 
 
 
474 aa  155  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102633  normal  0.0547084 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0703  cell cycle protein FtsW  33.03 
 
 
407 aa  155  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3957  stage V sporulation protein E  34.85 
 
 
363 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3762  stage V sporulation protein E  34.85 
 
 
363 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3653  stage V sporulation protein E  34.85 
 
 
363 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3670  stage V sporulation protein E  34.85 
 
 
363 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4012  stage V sporulation protein E  34.85 
 
 
363 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000045407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3964  stage V sporulation protein E  34.85 
 
 
363 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261778  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4050  stage V sporulation protein E  34.85 
 
 
363 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3926  stage V sporulation protein E  34.85 
 
 
363 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000164467 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3738  stage V sporulation protein E  35.2 
 
 
363 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>