More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3045 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_3045  FHA domain-containing protein  100 
 
 
174 aa  344  3e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000453276  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0874  FHA domain containing protein  35.57 
 
 
167 aa  87.4  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0908  FHA domain-containing protein  35 
 
 
162 aa  86.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000938723  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1426  FHA domain containing protein  29.79 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1054  FHA domain-containing protein  31.29 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000340466  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0025  FHA domain-containing protein  32.59 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0159  FHA domain containing protein  39.77 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1434  FHA domain-containing protein  46.91 
 
 
152 aa  67  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0740529  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1632  FHA domain containing protein  30.94 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3848  FHA domain containing protein  29.17 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105283  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  43.53 
 
 
848 aa  64.7  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0019  FHA domain-containing protein  43.59 
 
 
335 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0800  FHA domain-containing protein  43.59 
 
 
335 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55882  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1816  FHA domain-containing protein  42.17 
 
 
121 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3427  hypothetical protein  40 
 
 
503 aa  62.4  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.281438  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2865  FHA domain-containing protein  42.35 
 
 
332 aa  62  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2218  FHA domain-containing protein  42.35 
 
 
332 aa  62  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0618  FHA domain-containing protein  42.35 
 
 
332 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.657455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0633  FHA domain-containing protein  42.35 
 
 
332 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.723883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2489  FHA domain-containing protein  42.35 
 
 
332 aa  62  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.286925  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3061  FHA domain-containing protein  27.22 
 
 
159 aa  61.6  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.5 
 
 
1004 aa  61.6  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0513  FHA domain-containing protein  42.31 
 
 
335 aa  62  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0477326  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3863  FHA domain-containing protein  38.75 
 
 
503 aa  61.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.312796  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2805  serine/threonine kinase protein  41.79 
 
 
1157 aa  61.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2308  FHA domain-containing protein  28.37 
 
 
149 aa  60.8  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0512464  hitchhiker  0.000482709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  43.24 
 
 
866 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1788  FHA domain containing protein  41.03 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  43.24 
 
 
866 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  43.24 
 
 
866 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4189  adenylate/guanylate cyclase  39.24 
 
 
336 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0924354 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1693  FHA domain-containing protein  37.66 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514614  normal  0.923966 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4680  FHA domain-containing protein  36.78 
 
 
219 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3940  FHA domain-containing protein  37.65 
 
 
225 aa  58.9  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2541  FHA domain-containing protein  42.03 
 
 
514 aa  59.3  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.913197  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  41.89 
 
 
861 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1674  protein kinase  41.79 
 
 
1167 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  38.46 
 
 
513 aa  58.9  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0139  FHA domain-containing protein  24.14 
 
 
179 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0141963  hitchhiker  0.00495704 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0077  FHA domain containing protein  31.3 
 
 
234 aa  58.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.43292  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  43.24 
 
 
869 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1735  Forkhead-associated protein  41.33 
 
 
269 aa  58.5  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.164124  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2114  FHA domain containing protein  39.76 
 
 
121 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.508953  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3388  FHA domain containing protein  35.71 
 
 
211 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4172  FHA domain containing protein  36.99 
 
 
174 aa  58.2  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.815864 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4043  FHA domain-containing protein  35.71 
 
 
211 aa  58.2  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  41.89 
 
 
863 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0136  FHA domain containing protein  36.11 
 
 
177 aa  58.2  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.240573 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1480  winged helix family two component response transcriptional regulator  37.5 
 
 
221 aa  57.8  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.723328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  31.25 
 
 
346 aa  57.8  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  44.74 
 
 
863 aa  57.8  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2044  FHA domain containing protein  39.76 
 
 
121 aa  57.8  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  39.73 
 
 
238 aa  57.4  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27040  FHA domain-containing protein  28.17 
 
 
137 aa  57.8  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0013  FHA domain containing protein  38.27 
 
 
170 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.943282  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1334  FHA domain-containing protein  32.69 
 
 
520 aa  57  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1079  FHA domain containing protein  38.89 
 
 
317 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.153112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0116  FHA domain containing protein-like protein  23.84 
 
 
155 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0851255  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4431  FHA domain-containing protein  26.01 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2955 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  30 
 
 
354 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0023  FHA domain-containing protein  23.53 
 
 
153 aa  56.6  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0026  FHA domain containing protein  23.53 
 
 
154 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.259874  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1342  FHA domain containing protein  37.14 
 
 
137 aa  56.6  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061803 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0553  FHA domain-containing protein  41.43 
 
 
226 aa  55.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0951  FHA-domain containing protein  38.96 
 
 
269 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0026  FHA domain-containing protein  40.7 
 
 
280 aa  55.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2061  FHA domain-containing protein  40.54 
 
 
242 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3658  winged helix family two component response transcriptional regulator  34.95 
 
 
220 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2501  FHA domain-containing protein  38.27 
 
 
306 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.320482  decreased coverage  0.000381992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0050  FHA domain-containing protein  24.18 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00259691  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03330  FHA domain-containing protein  28.28 
 
 
138 aa  55.8  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0536542  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4212  adenylate/guanylate cyclase  42.86 
 
 
329 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1781  FHA domain-containing protein  37.18 
 
 
241 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206586  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4251  adenylate/guanylate cyclase  42.86 
 
 
329 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0807757  hitchhiker  0.000000663709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0068  FHA domain containing protein  24.69 
 
 
166 aa  55.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0026  FHA domain containing protein  31.63 
 
 
247 aa  55.5  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6711  putative sigma54 specific transcriptional regulator  34.15 
 
 
448 aa  55.1  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0798  FHA domain protein  42.47 
 
 
146 aa  54.7  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2548  FHA-domain containing protein  40.54 
 
 
251 aa  54.7  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0429  diguanylate cyclase  39.19 
 
 
338 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1268  hypothetical protein  34.25 
 
 
270 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.331296  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03340  FHA domain-containing protein  44.44 
 
 
408 aa  54.3  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0411441  normal  0.659189 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3040  FHA domain containing protein  25 
 
 
137 aa  54.7  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0026  FHA domain-containing protein  30.77 
 
 
248 aa  54.3  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1377  hypothetical protein  42.22 
 
 
233 aa  54.3  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4002  FHA domain-containing protein-like protein  39.74 
 
 
171 aa  54.3  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759759  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0338  FHA domain-containing protein  37.33 
 
 
144 aa  54.3  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1226  FHA domain-containing protein  39.24 
 
 
177 aa  54.3  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1823  FHA domain-containing protein  41.33 
 
 
863 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.997566  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0031  FHA domain containing protein  35.59 
 
 
235 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0457  diguanylate cyclase  39.19 
 
 
326 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2718  serine phosphatase  38.96 
 
 
533 aa  53.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482348  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5251  FHA domain containing protein  24.39 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.462718 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  41.33 
 
 
523 aa  53.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0091  FHA domain containing protein  37.97 
 
 
170 aa  53.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0041  FHA domain containing protein  38.67 
 
 
270 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23873  predicted protein  37.8 
 
 
698 aa  53.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3039  FHA domain containing protein  42.67 
 
 
414 aa  53.9  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0458  diguanylate cyclase  39.19 
 
 
326 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1753  FHA domain containing protein  32 
 
 
456 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00138455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>