30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3042 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_3042  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  550  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.44784e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08350  hypothetical protein  44.69 
 
 
265 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0617  hypothetical protein  43.38 
 
 
273 aa  230  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1913  hypothetical protein  42.18 
 
 
265 aa  221  9e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  3.12193e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1426  hypothetical protein  39.93 
 
 
276 aa  202  6e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0198  hypothetical protein  38.75 
 
 
261 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0181  hypothetical protein  38.75 
 
 
261 aa  180  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93703e-12 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2901  hypothetical protein  37 
 
 
297 aa  176  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.20399e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  34.56 
 
 
276 aa  65.9  7e-10  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  33.33 
 
 
273 aa  64.7  2e-09  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  35.58 
 
 
283 aa  60.8  2e-08  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  37.14 
 
 
278 aa  60.8  2e-08  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  28.57 
 
 
273 aa  58.5  1e-07  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  33.33 
 
 
273 aa  55.5  1e-06  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  31.85 
 
 
220 aa  52.4  7e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  29.08 
 
 
264 aa  52  1e-05  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3495  rhomboid family protein  34.44 
 
 
297 aa  51.6  1e-05  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  36.29 
 
 
226 aa  50.8  2e-05  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0066  rhomboid family protein  27.8 
 
 
244 aa  49.3  6e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167584  normal  0.0382417 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0599  AN1-type Zinc finger protein  28.87 
 
 
321 aa  48.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.715069  normal  0.614872 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  31.73 
 
 
284 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  27.51 
 
 
226 aa  47  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  25.6 
 
 
228 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  33.82 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  28.26 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  34.83 
 
 
286 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  28.48 
 
 
279 aa  43.5  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  33.88 
 
 
224 aa  43.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  28.99 
 
 
209 aa  42.4  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0016  hypothetical protein  29.51 
 
 
290 aa  42.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>