More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3037 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  100 
 
 		 212 aa  427  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  46.86 
 
 		 213 aa  218  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  30.62 
 
 		 178 aa  96.3  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  30.56 
 
 		 215 aa  94.7  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  28.85 
 
 		 177 aa  93.6  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  28.64 
 
 		 180 aa  92.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  30.77 
 
 		 190 aa  89  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  29.68 
 
 		 215 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  30.57 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  34.01 
 
 		 166 aa  87.4  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  31.13 
 
 		 201 aa  85.1  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  27.18 
 
 		 167 aa  85.1  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  27.94 
 
 		 170 aa  85.1  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  33.16 
 
 		 166 aa  84.3  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  28.9 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  27.36 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  29.11 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  28.78 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 215 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  28.9 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  29.03 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  28.44 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  30.92 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  26.9 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  30.05 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  25.13 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  28.93 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  29.12 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  24.06 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  28.14 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  27.18 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  27.14 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  27.98 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  28.87 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  26.02 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  32.85 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  28.95 
 
 		 188 aa  72  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  31.4 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  28.5 
 
 		 186 aa  72  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  28.08 
 
 		 176 aa  72  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  28.27 
 
 		 186 aa  72  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.95 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.19 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  24.49 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  24.75 
 
 		 163 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  26.73 
 
 		 163 aa  70.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  28.65 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2476  nitroreductase  29.35 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  27.23 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  28.65 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3715  nitroreductase  25 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0995943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  25.5 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  26.94 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  30.3 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  25.12 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  27.72 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  26.87 
 
 		 173 aa  67.8  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00135  nitroreductase  30.77 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  27.49 
 
 		 166 aa  67.8  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  23.81 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  27.23 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0728  nitroreductase  31.55 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.782562  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  27.98 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  29.59 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  27.4 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  29.5 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  25.85 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  24.75 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  28.12 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  24.48 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2047  putative nitroreductase  29.8 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01399e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  27.86 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  26.73 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0947  nitroreductase  28.8 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  22.71 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  32.04 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  25.13 
 
 		 209 aa  62  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2969  nitroreductase  30 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  26.46 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  26.13 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  26.17 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0762  nitroreductase  28.8 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  27.98 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  23.96 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  26.05 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  27.27 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  25.77 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  26.67 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  27.27 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  26.63 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  24.73 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  25 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5732  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.82 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  26.38 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0743  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.79 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  28.04 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>