More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3006 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  100 
 
 		 289 aa  580  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3007  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  55.36 
 
 		 230 aa  251  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  50.29 
 
 		 173 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3372  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.17 
 
 		 165 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3222  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.56 
 
 		 165 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  48.57 
 
 		 179 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2404  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.96 
 
 		 112 aa  132  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  57.8 
 
 		 283 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21900  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.94 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21380  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.78 
 
 		 181 aa  125  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  56.07 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  42.94 
 
 		 307 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1729  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  52 
 
 		 205 aa  123  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.698671 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0093  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.35 
 
 		 192 aa  122  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  58.95 
 
 		 115 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0200  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.72 
 
 		 175 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.502395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0101  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.65 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1148  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.16 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0738995  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1258  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.87 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.818065  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0982  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.17 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000253435  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0476  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.57 
 
 		 206 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0633  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.35 
 
 		 253 aa  113  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1510  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.44 
 
 		 307 aa  112  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360333  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3627  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.47 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000535955  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0668  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.46 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.988638  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0590  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.02 
 
 		 389 aa  109  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0600559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0318  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  52.78 
 
 		 230 aa  109  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000150825  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  41.1 
 
 		 546 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4076  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.11 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1239  Peptidoglycan-binding LysM  46.21 
 
 		 156 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48 
 
 		 411 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000751939 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1784  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.66 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.909249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0664  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.74 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0825  hypothetical protein  42.74 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2602e-53 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0434  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.66 
 
 		 266 aa  106  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1978  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.27 
 
 		 223 aa  105  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0913  hypothetical protein  40.65 
 
 		 253 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2694  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.45 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0656  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.88 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0546  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.68 
 
 		 415 aa  104  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4524  hypothetical protein  40.65 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0816159 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0819  hypothetical protein  41.88 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.11 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0072  hypothetical protein  41.54 
 
 		 153 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0411  hypothetical protein  33.66 
 
 		 314 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1763  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.66 
 
 		 314 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  37.95 
 
 		 338 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4858  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.77 
 
 		 153 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  38.2 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5178  hypothetical protein  40.77 
 
 		 153 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3988  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.87 
 
 		 409 aa  99.4  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4762  hypothetical protein  40.31 
 
 		 153 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5172  hypothetical protein  39.53 
 
 		 153 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3894  ErfK/SrfK protein  45.9 
 
 		 186 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000648074  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4743  hypothetical protein  39.53 
 
 		 153 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5187  hypothetical protein  39.53 
 
 		 153 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  35.57 
 
 		 568 aa  97.4  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0806  hypothetical protein  44.44 
 
 		 219 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0412  LysM domain-containing protein  35.26 
 
 		 434 aa  97.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4899  hypothetical protein  39.53 
 
 		 153 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5274  hypothetical protein  39.53 
 
 		 153 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5143  hypothetical protein  39.53 
 
 		 153 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3989  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.08 
 
 		 186 aa  96.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.61 
 
 		 255 aa  96.3  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4221  hypothetical protein  45.08 
 
 		 186 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00480298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4055  hypothetical protein  45.08 
 
 		 186 aa  96.3  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3901  erfK/srfK protein  45.08 
 
 		 186 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00361052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4372  hypothetical protein  45.08 
 
 		 186 aa  96.3  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4170  hypothetical protein  45.08 
 
 		 186 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2124  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.09 
 
 		 216 aa  95.9  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4281  hypothetical protein  45.08 
 
 		 186 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0049222  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1637  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.52 
 
 		 474 aa  95.9  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000221895  hitchhiker  0.00347843 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1457  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG protein family protein  34.52 
 
 		 473 aa  95.5  9e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000050747  normal  0.073975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4081  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.85 
 
 		 409 aa  95.5  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.93 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.550857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3616  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.83 
 
 		 156 aa  95.1  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0304  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.08 
 
 		 168 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1027  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.65 
 
 		 464 aa  94.7  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0971  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.58 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0183  putative lipoprotein  34.92 
 
 		 435 aa  93.6  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2287  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.62 
 
 		 167 aa  93.2  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000631193  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2845  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.26 
 
 		 169 aa  93.2  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0975  hypothetical protein  43.44 
 
 		 186 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0886923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4260  hypothetical protein  43.44 
 
 		 186 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0203289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3485  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.45 
 
 		 482 aa  92.4  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2161  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.39 
 
 		 439 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2123  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.41 
 
 		 219 aa  91.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2980  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.43 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0573  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.22 
 
 		 441 aa  91.3  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  33.71 
 
 		 409 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0647  hypothetical protein  37.1 
 
 		 180 aa  90.5  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3289  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.47 
 
 		 307 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1303  peptidoglycan-binding LysM  48.18 
 
 		 112 aa  90.1  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.290391  normal  0.428505 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0927  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.52 
 
 		 432 aa  89.4  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000328138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3219  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.01 
 
 		 204 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0123  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 		 396 aa  89  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.39 
 
 		 797 aa  87.8  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2943  hypothetical protein  31.34 
 
 		 423 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2889  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33 
 
 		 466 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1796  hypothetical protein  28.15 
 
 		 526 aa  86.7  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00047579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>