80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2943 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2943  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 405 aa  805    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  37 
 
 		 394 aa  266  7e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  36.72 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0112  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  34.98 
 
 		 403 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1529  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  28.92 
 
 		 409 aa  180  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1790  putative sodium ABC transporter permease protein  26.27 
 
 		 395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1957  ABC-2 type transporter  25.85 
 
 		 388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0574803  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2950  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  26.65 
 
 		 397 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404593  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03077  putative ABC-type Na+ efflux pump, permease component  27.94 
 
 		 398 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3872  ABC transporter sodium permease  25.97 
 
 		 394 aa  124  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1676  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 413 aa  123  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02800  ABC transporter sodium permease  26.85 
 
 		 397 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1500  ABC transporter sodium permease  27.07 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809114  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1445  ABC transporter sodium permease  26.59 
 
 		 394 aa  117  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.757965  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3196  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  31.68 
 
 		 408 aa  109  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109527 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0115  ABC-2 type transporter  25.24 
 
 		 405 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  25.66 
 
 		 775 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3144  Abortive infection protein  27.33 
 
 		 830 aa  107  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569126  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3782  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4462  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.510043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4866  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 		 387 aa  98.6  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4192  ABC-2 type transporter  24.69 
 
 		 381 aa  97.1  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148286  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0066  transport protein, putative  25.69 
 
 		 378 aa  96.7  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0055  transport protein, putative  24.69 
 
 		 379 aa  93.6  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0074  transport protein, putative  24.69 
 
 		 379 aa  93.2  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0069  transport protein, putative  24.25 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0071  transport protein, putative  24.25 
 
 		 379 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0069  transport protein, putative  24.32 
 
 		 379 aa  90.9  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4280  transport protein, putative  24.25 
 
 		 379 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0070  transport protein, putative  23.25 
 
 		 379 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0072  transport protein, putative  24.32 
 
 		 379 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0074  transport protein, putative  23.94 
 
 		 379 aa  89  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000331098 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3799  Na+ ABC transporter permease protein  23.1 
 
 		 397 aa  88.2  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.578241  normal  0.0174839 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1131  ABC-2 type transporter  25.85 
 
 		 390 aa  86.7  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.315475  hitchhiker  0.00237195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3735  heavy metal efflux pump CzcA  23.92 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3979  ABC-2 type transporter  23.57 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.508382  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3577  transport protein, putative  23.95 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0724  protein NatB  24.43 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  22.66 
 
 		 375 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  21.89 
 
 		 383 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  21.89 
 
 		 383 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  23.34 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0209  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 396 aa  51.2  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19710  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 193 aa  50.1  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  23.17 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 371 aa  48.9  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  23.72 
 
 		 372 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  22.05 
 
 		 378 aa  47.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1421  ABC-2 type transporter  20.67 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  21.59 
 
 		 383 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  21.98 
 
 		 360 aa  47  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.23 
 
 		 365 aa  47  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19720  hypothetical protein  25.31 
 
 		 157 aa  46.6  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  25.57 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1135  hypothetical protein  22.98 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4513  hypothetical protein  22.1 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.2961  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  21.09 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  21.53 
 
 		 912 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1684  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 243 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  21.24 
 
 		 912 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  23.17 
 
 		 364 aa  44.7  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  19.01 
 
 		 379 aa  45.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  22.88 
 
 		 369 aa  44.3  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  21.17 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  21.17 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  21.17 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  20.65 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  21.17 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  21.17 
 
 		 368 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  22.75 
 
 		 375 aa  43.9  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2422  ABC-2 type transporter  22.53 
 
 		 379 aa  43.5  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108502  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  23.26 
 
 		 373 aa  43.5  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  21.04 
 
 		 376 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  21.13 
 
 		 901 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  21.04 
 
 		 376 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  21.04 
 
 		 376 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  21.04 
 
 		 376 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  21.13 
 
 		 901 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  22.41 
 
 		 391 aa  42.7  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>