More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2942 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  100 
 
 		 251 aa  513  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  64.05 
 
 		 243 aa  332  4e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  63.22 
 
 		 243 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  64.44 
 
 		 241 aa  328  6e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1528  ABC transporter related  53.09 
 
 		 246 aa  255  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  45.77 
 
 		 274 aa  245  4e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1675  ABC transporter related  46.75 
 
 		 246 aa  238  9e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  46.69 
 
 		 248 aa  228  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  46.28 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1501  sodium ABC transporter ATP-binding protein  46.28 
 
 		 248 aa  226  4e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  44.63 
 
 		 248 aa  223  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  54.12 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  44.96 
 
 		 244 aa  216  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  42.97 
 
 		 252 aa  216  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  44.96 
 
 		 244 aa  215  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1791  ABC transporter-like protein  47.23 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  52.28 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  45.38 
 
 		 244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0768  ABC transporter related protein  43.39 
 
 		 255 aa  211  7e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3195  ABC transporter related protein  44.54 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  44.12 
 
 		 244 aa  209  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  43.28 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  43.28 
 
 		 244 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  43.28 
 
 		 244 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  43.28 
 
 		 244 aa  206  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  42.86 
 
 		 244 aa  205  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  42.86 
 
 		 244 aa  204  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  44.73 
 
 		 240 aa  205  7e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  43.28 
 
 		 244 aa  204  9e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  42.54 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  42.44 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  42.44 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  42.86 
 
 		 244 aa  202  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  41.6 
 
 		 244 aa  202  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  43.28 
 
 		 244 aa  201  8e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.02 
 
 		 334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  44.34 
 
 		 303 aa  199  5e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  40.08 
 
 		 282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  40.17 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0393  ABC transporter related  42.31 
 
 		 244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  40.89 
 
 		 332 aa  196  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  41.91 
 
 		 512 aa  196  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0376  ABC transporter related  41.88 
 
 		 244 aa  195  6e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.65 
 
 		 317 aa  195  6e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1005  ABC transporter related  41.33 
 
 		 257 aa  195  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00810555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  40.25 
 
 		 257 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  42.6 
 
 		 301 aa  193  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  37.6 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.54 
 
 		 330 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  39.11 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.73 
 
 		 339 aa  191  9e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.04 
 
 		 316 aa  191  9e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  43.69 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  40.91 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  41.15 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  44 
 
 		 341 aa  190  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  38.91 
 
 		 314 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.06 
 
 		 323 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  38.37 
 
 		 320 aa  189  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3116  ABC transporter related  41.33 
 
 		 326 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.389623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  40.25 
 
 		 247 aa  189  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  40.89 
 
 		 298 aa  189  5e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.48 
 
 		 325 aa  189  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3800  sodium ABC transporter ATP-binding protein  38.89 
 
 		 262 aa  189  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.939362  hitchhiker  0.00685635 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  38.63 
 
 		 295 aa  188  5.999999999999999e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  40.09 
 
 		 312 aa  188  8e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.09 
 
 		 328 aa  187  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.76 
 
 		 329 aa  187  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 		 327 aa  186  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.04 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  36.21 
 
 		 247 aa  186  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1130  ABC transporter related  42.53 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  hitchhiker  0.000478037 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0114  ABC transporter related  43.44 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  40.99 
 
 		 338 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.31 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  40.68 
 
 		 236 aa  186  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  40.17 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  40.44 
 
 		 327 aa  185  5e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  43.11 
 
 		 327 aa  185  7e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  39.19 
 
 		 334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.15 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  39.91 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  42.34 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 		 306 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0723  ATP-binding transport protein NatA  40.41 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  39.36 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  40.6 
 
 		 314 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  39.17 
 
 		 583 aa  182  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  41.78 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  37.23 
 
 		 312 aa  182  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  40.09 
 
 		 319 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  38.06 
 
 		 337 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  37.6 
 
 		 581 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  39.32 
 
 		 306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  39.58 
 
 		 541 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  38.84 
 
 		 593 aa  181  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  37.7 
 
 		 330 aa  181  7e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  39.15 
 
 		 270 aa  181  8.000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.3 
 
 		 317 aa  181  8.000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 589 aa  181  9.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>