271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2937 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  100 
 
 		 269 aa  543  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  58.71 
 
 		 267 aa  345  7e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  56.45 
 
 		 268 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  55.65 
 
 		 268 aa  300  1e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  54.44 
 
 		 270 aa  292  3e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  51.49 
 
 		 268 aa  278  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  48.5 
 
 		 263 aa  261  8.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  48.5 
 
 		 263 aa  261  8.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  53.94 
 
 		 265 aa  257  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  44.06 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  47.5 
 
 		 267 aa  242  5e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  46.75 
 
 		 269 aa  238  5e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  44.49 
 
 		 264 aa  236  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  48.78 
 
 		 265 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  44.49 
 
 		 264 aa  235  7e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  44.49 
 
 		 264 aa  234  8e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  44.11 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  44.11 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  44.11 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  44.11 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  44.11 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  43.73 
 
 		 264 aa  233  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  48.35 
 
 		 262 aa  232  5e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  43.73 
 
 		 264 aa  232  6e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  43.73 
 
 		 264 aa  232  6e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  47.15 
 
 		 265 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  44.81 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  44.49 
 
 		 266 aa  219  3e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  42.21 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  42.21 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  40.38 
 
 		 266 aa  216  4e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  41.22 
 
 		 269 aa  208  6e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  40 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  41.46 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  43.67 
 
 		 267 aa  198  7e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  41.47 
 
 		 264 aa  198  7e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  36.4 
 
 		 265 aa  192  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  42.08 
 
 		 264 aa  191  9e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  42.11 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  36.09 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  37.76 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  38.89 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0320  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  41.56 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00398229  hitchhiker  1.85295e-17 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24080  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  43.5 
 
 		 266 aa  172  5.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  34.68 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12580  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  37.55 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2300  cobalt ABC transporter permease protein  39.43 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000489641  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  36.44 
 
 		 810 aa  159  6e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  29.92 
 
 		 269 aa  155  7e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0997  cobalt transport protein  41.25 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  normal  0.445886 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  34.21 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  36.68 
 
 		 770 aa  154  2e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  32.3 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  33.83 
 
 		 271 aa  149  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  51.77 
 
 		 438 aa  149  5e-35  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  34.19 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  30.34 
 
 		 336 aa  142  5e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2799  cobalt transport protein  35.1 
 
 		 284 aa  135  7.000000000000001e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161091  hitchhiker  0.0000401783 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  29.28 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  31.54 
 
 		 257 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1964  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit  32.18 
 
 		 255 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  29.89 
 
 		 314 aa  124  1e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  31.84 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0352  cobalt transport protein  32.22 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1130  cobalt transport protein  34.93 
 
 		 258 aa  112  8.000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19680  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  30.26 
 
 		 231 aa  109  5e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0554754  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  31.67 
 
 		 252 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  32.19 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  30.68 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  29.06 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  29.82 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2867  cobalt transport protein  26.79 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3229  cobalt transport protein  26.79 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1257  cobalt transport protein  30.22 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000290738  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  28.33 
 
 		 243 aa  88.6  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  29.05 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3565  cobalt transport protein  25.75 
 
 		 309 aa  87  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0616568  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2897  cobalt transport protein  23.26 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00540411  hitchhiker  0.000146213 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1229  cobalt transport protein  30.97 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.379694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0884  cobalt transport protein  30.97 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  28.44 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  28.3 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  24.91 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1751  cobalt transport protein  26.94 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253796  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0598  cobalt transport protein  26.61 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157547  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  28.57 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4361  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.57 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01470  Cobalt transport protein  22.48 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0260035  normal  0.244881 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  25.94 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  24.44 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  27.64 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0682  cobalt transport protein  26.23 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000924748  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  27.24 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  23.39 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  30.57 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3687  cobalt transport protein  24.31 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1329  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.31 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378958  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1768  ABC transporter, permease protein  25.7 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.689624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  24.03 
 
 		 291 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  24.03 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>