More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2924 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  100 
 
 		 217 aa  442  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  64.79 
 
 		 215 aa  302  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  66.2 
 
 		 214 aa  294  6e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  59.07 
 
 		 217 aa  266  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  55.19 
 
 		 214 aa  263  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  54.72 
 
 		 213 aa  259  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  55.87 
 
 		 215 aa  258  4e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  54.72 
 
 		 217 aa  257  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  54.25 
 
 		 217 aa  254  7e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  51.89 
 
 		 217 aa  254  9e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  54.72 
 
 		 215 aa  252  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  53.99 
 
 		 214 aa  251  5.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  54.25 
 
 		 215 aa  251  7e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  54.25 
 
 		 215 aa  251  7e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  52.78 
 
 		 216 aa  248  6e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  52.11 
 
 		 217 aa  246  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  53.7 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  53.7 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  51.42 
 
 		 211 aa  244  4.9999999999999997e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  54.72 
 
 		 215 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  56.25 
 
 		 216 aa  244  4.9999999999999997e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  50.94 
 
 		 213 aa  244  6e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  52.88 
 
 		 216 aa  244  9e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  51.89 
 
 		 217 aa  242  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  51.92 
 
 		 216 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  51.92 
 
 		 216 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  51.92 
 
 		 216 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  51.92 
 
 		 216 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  51.92 
 
 		 216 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  51.92 
 
 		 216 aa  241  7e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  51.92 
 
 		 216 aa  241  7e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  51.92 
 
 		 216 aa  241  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  51.89 
 
 		 217 aa  239  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  51.44 
 
 		 216 aa  239  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  51.92 
 
 		 216 aa  239  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  51.17 
 
 		 217 aa  239  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  50.94 
 
 		 217 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  50.94 
 
 		 217 aa  238  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  50.94 
 
 		 216 aa  237  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  50 
 
 		 216 aa  237  9e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  50.23 
 
 		 219 aa  237  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  50.93 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  50 
 
 		 215 aa  236  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  50.94 
 
 		 217 aa  236  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  52.78 
 
 		 218 aa  236  2e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2312  adenylate kinase  51.5 
 
 		 215 aa  234  8e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00140159  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  48.84 
 
 		 217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1001  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  52.13 
 
 		 215 aa  231  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000583079  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  51.49 
 
 		 213 aa  231  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0167  adenylate kinases  49.06 
 
 		 228 aa  231  9e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0999685  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  51.85 
 
 		 219 aa  229  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  47.17 
 
 		 214 aa  229  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  47.17 
 
 		 214 aa  228  6e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0952  adenylate kinase  51.34 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2952  adenylate kinase  52.04 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2058  adenylate kinase  49.54 
 
 		 215 aa  225  4e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332952  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2153  adenylate kinase  49.77 
 
 		 218 aa  224  6e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  46.48 
 
 		 216 aa  224  7e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0974  adenylate kinase  51.89 
 
 		 214 aa  224  7e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0769  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  51.89 
 
 		 215 aa  224  9e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.8085  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1112  adenylate kinase  53.03 
 
 		 209 aa  223  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1088  adenylate kinase  50.46 
 
 		 215 aa  224  1e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.670242  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  52.29 
 
 		 215 aa  223  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1886  adenylate kinase  50 
 
 		 218 aa  223  1e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00135603  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3205  adenylate kinase  49.55 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129481  normal  0.282312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  52.27 
 
 		 216 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  47.2 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0055  adenylate kinase  51.35 
 
 		 218 aa  222  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4111  adenylate kinase  51.82 
 
 		 216 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1111  adenylate kinase  51.82 
 
 		 216 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2488  adenylate kinase  50.23 
 
 		 217 aa  221  9e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317591  normal  0.964457 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2561  adenylate kinase  50.68 
 
 		 218 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.072453  decreased coverage  0.00219618 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3158  adenylate kinase  50.9 
 
 		 218 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.350521  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0763  adenylate kinase  56.02 
 
 		 221 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1920  adenylate kinase  50.68 
 
 		 218 aa  220  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1506  adenylate kinase  51.36 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.614097  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1509  adenylate kinase  52.51 
 
 		 215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4300  adenylate kinase  48.85 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4216  adenylate kinase  51.36 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1319  adenylate kinase  51.6 
 
 		 215 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.176093  hitchhiker  0.00352848 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  46.67 
 
 		 217 aa  218  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0507  adenylate kinase  50 
 
 		 214 aa  218  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004136  adenylate kinase  51.38 
 
 		 214 aa  218  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3212  adenylate kinase  49.55 
 
 		 217 aa  218  6e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3199  adenylate kinase  55.5 
 
 		 221 aa  218  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0957  adenylate kinases  52.07 
 
 		 214 aa  217  8.999999999999998e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833948  normal  0.567564 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0354  adenylate kinase  56.45 
 
 		 222 aa  217  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0857  adenylate kinase  49.55 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1739  adenylate kinases  49.32 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000022686  normal  0.166056 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1798  adenylate kinase  50.46 
 
 		 214 aa  216  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000131299  hitchhiker  0.000000153174 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1140  adenylate kinase  51.64 
 
 		 208 aa  216  1e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000592914  normal  0.025222 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1504  adenylate kinase  56.99 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179397 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2308  adenylate kinase  49.32 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00367216  normal  0.15407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1551  adenylate kinase  49.32 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399055  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1528  adenylate kinase  51.38 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01328  adenylate kinase  50.92 
 
 		 214 aa  216  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2235  adenylate kinase  54.26 
 
 		 218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00391254  hitchhiker  0.0000168537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2638  adenylate kinase  49.32 
 
 		 218 aa  215  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.517304  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0648  adenylate kinase  49.54 
 
 		 214 aa  214  5.9999999999999996e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0373092  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1373  adenylate kinase  50.96 
 
 		 220 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000458386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>