More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2922 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 146 aa  288  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  80.95 
 
 		 147 aa  234  4e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  69.18 
 
 		 146 aa  200  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  70.55 
 
 		 146 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  69.86 
 
 		 146 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  69.86 
 
 		 146 aa  196  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  69.18 
 
 		 146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  69.18 
 
 		 146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  69.18 
 
 		 146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  69.18 
 
 		 146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  69.18 
 
 		 146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  69.18 
 
 		 146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  68.49 
 
 		 146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  69.18 
 
 		 146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  68.49 
 
 		 146 aa  194  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  69.18 
 
 		 146 aa  192  9e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  66.9 
 
 		 146 aa  192  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  66.9 
 
 		 146 aa  192  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  68.49 
 
 		 146 aa  190  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  67.35 
 
 		 147 aa  187  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  65.75 
 
 		 146 aa  187  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  66.44 
 
 		 146 aa  186  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  66.44 
 
 		 146 aa  186  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 		 146 aa  185  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  64.63 
 
 		 147 aa  184  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  66.44 
 
 		 146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  65.07 
 
 		 146 aa  181  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  64.38 
 
 		 146 aa  181  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  67.12 
 
 		 147 aa  180  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  64.38 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  66.67 
 
 		 147 aa  177  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  64.83 
 
 		 149 aa  174  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  62.59 
 
 		 147 aa  174  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  60.96 
 
 		 147 aa  173  9e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  67.35 
 
 		 147 aa  170  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  63.95 
 
 		 146 aa  169  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  62.33 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  59.59 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  60.27 
 
 		 144 aa  163  8e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  61.22 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1555  ribosomal protein L15  62.67 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00234278  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  59.86 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  59.86 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 146 aa  158  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 146 aa  158  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  53.42 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  59.44 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  55.24 
 
 		 154 aa  151  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  58.9 
 
 		 146 aa  150  7e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  56.08 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  57.53 
 
 		 172 aa  146  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  54.86 
 
 		 147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  57.14 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  54.42 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  53.74 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  53.74 
 
 		 153 aa  140  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0999  ribosomal protein L15  57.43 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  53.74 
 
 		 153 aa  139  9e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  50.99 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  51.66 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  51.66 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1975  50S ribosomal protein L15  52.32 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0984244  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  54.17 
 
 		 144 aa  136  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3895  50S ribosomal protein L15  52.08 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1373  50S ribosomal protein L15  52.63 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.131365 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0440  50S ribosomal protein L15P  54.17 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124289  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0601  50S ribosomal protein L15  52.08 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000630291  normal  0.89254 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0302  50S ribosomal protein L15  52.08 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000713012  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1112  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19861  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4525  50S ribosomal protein L15  51.39 
 
 		 144 aa  134  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000156874  hitchhiker  0.000171514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 176 aa  133  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2382  50S ribosomal protein L15  55.86 
 
 		 147 aa  133  9e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000043437  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3982  50S ribosomal protein L15  54.48 
 
 		 144 aa  133  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442954  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 148 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1005  50S ribosomal protein L15  48.68 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10484  normal  0.0101477 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3505  ribosomal protein L15  52.78 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000855163  hitchhiker  0.0000000902196 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  50.66 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1449  50S ribosomal protein L15  49.34 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829233  normal  0.185187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 167 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0445  50S ribosomal protein L15  53.79 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000479613  hitchhiker  0.000107522 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0620  ribosomal protein L15  52.78 
 
 		 144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527453  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2576  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 147 aa  130  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 159 aa  130  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 159 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1351  50S ribosomal protein L15  48.68 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000319107  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0561  50S ribosomal protein L15  53.29 
 
 		 164 aa  130  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00749  50S ribosomal protein L15  55.56 
 
 		 144 aa  130  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  47.37 
 
 		 160 aa  130  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3732  50S ribosomal protein L15  56.55 
 
 		 144 aa  130  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00107174  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 153 aa  130  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>