262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2921 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2921  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 59 aa  118  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000749762  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  66.1 
 
 		 59 aa  77  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  63.79 
 
 		 59 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  63.16 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  59.65 
 
 		 62 aa  68.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 59 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 61 aa  63.9  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 59 aa  63.9  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 61 aa  63.5  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1143  ribosomal protein L30  58.33 
 
 		 61 aa  63.5  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000025708  normal  0.0109898 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  59.26 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1358  ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2696  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 57 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2381  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 57 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  49.15 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 62 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0212  LSU ribosomal protein L30P  47.37 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161029  normal  0.28126 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  57  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  57  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1854  ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  57  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000293494  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0269  ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.935152 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  50.85 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2307  50S ribosomal protein L30  54.72 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.227659  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  45.76 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0493  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  45.76 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06430  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4731  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 58 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000152085  normal  0.600234 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0472  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291193  hitchhiker  0.00000269713 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3310  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0951  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0200139  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0502  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000122641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2932  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000405636 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0505  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00113735  normal  0.0573997 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0391  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000847959  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3279  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0271147  hitchhiker  0.00015076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5052  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0294  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000487608  normal  0.0630356 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1040  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127741  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2614  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177274  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2821  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238696  normal  0.243188 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3758  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0279178  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3465  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0155512  normal  0.071059 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3050  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0897802  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  46.43 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3299  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2741  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0301719  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0285  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104363  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0345  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0645299 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3496  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943573  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0366  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139804  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0267  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.16996  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0399  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3151  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0153482  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1942  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3728  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00881974  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3786  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3001  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  46.67 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0338  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0500477  hitchhiker  0.00104601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3161  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158521  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 62 aa  53.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1556  ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000500993  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09030  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 58 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0258453  normal  0.264293 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0855  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 58 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.342105  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1725  50S ribosomal protein L30  48.33 
 
 		 61 aa  53.5  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000657277  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5061  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 58 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000009319  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0332  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00936849  decreased coverage  0.00323406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3626  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000585179  hitchhiker  0.0000000000133791 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1747  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 56 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.652105  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>