More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2919 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  100 
 
 		 122 aa  246  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  68.03 
 
 		 122 aa  174  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  64.75 
 
 		 119 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  66.39 
 
 		 121 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  64.75 
 
 		 122 aa  160  7e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  63.93 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  67.86 
 
 		 125 aa  157  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  63.93 
 
 		 120 aa  157  6e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  63.93 
 
 		 120 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  62.3 
 
 		 120 aa  153  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  57.38 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  65.57 
 
 		 119 aa  152  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  65.57 
 
 		 119 aa  152  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  63.93 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  62.3 
 
 		 120 aa  149  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  63.11 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  63.96 
 
 		 120 aa  149  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  61.48 
 
 		 120 aa  147  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  62.28 
 
 		 118 aa  146  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  62.9 
 
 		 120 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  58.77 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  68.03 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  68.03 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 		 120 aa  144  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 		 120 aa  144  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 		 120 aa  144  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 		 120 aa  144  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 		 120 aa  144  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 		 120 aa  144  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 		 120 aa  144  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 		 120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  66.99 
 
 		 122 aa  144  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  59.66 
 
 		 120 aa  143  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  60.16 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  62.73 
 
 		 120 aa  141  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  60.16 
 
 		 118 aa  140  4e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  60 
 
 		 120 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 		 122 aa  140  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  54.92 
 
 		 122 aa  140  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  57.94 
 
 		 124 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  54.92 
 
 		 122 aa  138  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1168  ribosomal protein L18  64.65 
 
 		 113 aa  135  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.257071  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  58.2 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  55.65 
 
 		 122 aa  135  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  58.41 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0275  ribosomal protein L18  52.94 
 
 		 123 aa  135  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0485826  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  63.16 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  62.38 
 
 		 120 aa  134  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  59.02 
 
 		 121 aa  134  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0231  50S ribosomal protein L18  57.38 
 
 		 122 aa  134  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00019392  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  58.62 
 
 		 128 aa  134  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 		 116 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  58.62 
 
 		 120 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  64.71 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  56.91 
 
 		 119 aa  133  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  57.98 
 
 		 115 aa  130  3.9999999999999996e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0438  50S ribosomal protein L18  59.02 
 
 		 122 aa  130  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.560325  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  55.28 
 
 		 117 aa  130  5e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  61.74 
 
 		 124 aa  130  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0302  50S ribosomal protein L18  64.65 
 
 		 122 aa  130  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000021695  normal  0.152998 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4491  ribosomal protein L18  59.65 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  54.1 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  56.56 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  54.1 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  54.92 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  54.95 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1307  50S ribosomal protein L18  62.75 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  56.3 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  61.95 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  57.66 
 
 		 122 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0210  LSU ribosomal protein L18P  60.4 
 
 		 121 aa  127  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0545165  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  59.29 
 
 		 117 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  55.26 
 
 		 124 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  54.95 
 
 		 122 aa  126  8.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1139  ribosomal protein L18  58.26 
 
 		 122 aa  126  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2385  50S ribosomal protein L18  62.3 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00226335  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4782  50S ribosomal protein L18  55.86 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127323  hitchhiker  0.000000074744 
 
 
-
 
NC_002936  DET0490  50S ribosomal protein L18  52.89 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2185  50S ribosomal protein L18  63.16 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.954863  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0467  50S ribosomal protein L18  52.89 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  54.95 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  55.75 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2463  50S ribosomal protein L18  63.16 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  54.95 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  57.63 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0337  50S ribosomal protein L18  62.11 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  62.96 
 
 		 128 aa  124  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0603  ribosomal protein L18  58.26 
 
 		 123 aa  125  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  56.9 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  57.38 
 
 		 121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  56.9 
 
 		 120 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  56.52 
 
 		 120 aa  123  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  53.15 
 
 		 122 aa  123  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1924  50S ribosomal protein L18  61.05 
 
 		 120 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845183  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  63.16 
 
 		 120 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1561  50S ribosomal protein L18  56.52 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>