More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2910 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  100 
 
 
145 aa  295  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  88.97 
 
 
145 aa  266  8e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  85.52 
 
 
144 aa  253  8e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  81.38 
 
 
147 aa  240  5e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  78.62 
 
 
145 aa  238  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  81.25 
 
 
145 aa  234  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  79.86 
 
 
144 aa  233  8e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  79.02 
 
 
144 aa  231  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  79.02 
 
 
144 aa  231  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  77.24 
 
 
144 aa  229  9e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  77.24 
 
 
145 aa  229  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  74.48 
 
 
144 aa  228  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  75.86 
 
 
144 aa  226  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  77.37 
 
 
140 aa  222  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  74.45 
 
 
139 aa  221  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  77.24 
 
 
144 aa  221  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  74.81 
 
 
140 aa  220  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  73.05 
 
 
142 aa  220  6e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  75.54 
 
 
139 aa  217  3.9999999999999997e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  74.1 
 
 
139 aa  214  4e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  72.79 
 
 
141 aa  214  4e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23400  LSU ribosomal protein L16P  75.18 
 
 
143 aa  213  5e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000203395  hitchhiker  0.00000101059 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  74.26 
 
 
139 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  72.26 
 
 
139 aa  212  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  72.26 
 
 
139 aa  212  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  72.41 
 
 
144 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  72.6 
 
 
144 aa  211  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  70.8 
 
 
137 aa  210  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  71.72 
 
 
144 aa  210  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  72.06 
 
 
142 aa  210  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  71.72 
 
 
144 aa  210  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  71.72 
 
 
144 aa  210  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  71.03 
 
 
144 aa  210  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  71.03 
 
 
144 aa  210  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  71.03 
 
 
144 aa  210  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  71.03 
 
 
144 aa  210  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  71.03 
 
 
144 aa  210  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  71.03 
 
 
144 aa  210  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  71.03 
 
 
144 aa  210  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  74.65 
 
 
141 aa  210  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  73.38 
 
 
139 aa  210  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  71.94 
 
 
139 aa  210  7e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  71.32 
 
 
145 aa  209  9e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  72.66 
 
 
139 aa  209  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  71.01 
 
 
142 aa  208  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23091  50S ribosomal protein L16  69.06 
 
 
158 aa  207  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  72.06 
 
 
139 aa  206  8e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16711  50S ribosomal protein L16  69.63 
 
 
179 aa  206  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  69.54 
 
 
151 aa  206  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0313  50S ribosomal protein L16  71.74 
 
 
139 aa  206  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0569  50S ribosomal protein L16  72.59 
 
 
139 aa  204  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09930  LSU ribosomal protein L16P  71.53 
 
 
140 aa  204  3e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.11543  hitchhiker  0.0000034816 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  69.12 
 
 
140 aa  204  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  69.63 
 
 
139 aa  204  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2311  50S ribosomal protein L16  68.97 
 
 
144 aa  203  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2270  50S ribosomal protein L16  68.97 
 
 
144 aa  203  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000763654  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 
151 aa  202  9e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20800  LSU ribosomal protein L16P  66.9 
 
 
139 aa  202  9e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1824  50S ribosomal protein L16  68.97 
 
 
144 aa  202  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.418493  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19961  50S ribosomal protein L16  64.29 
 
 
161 aa  201  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.64825  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1962  50S ribosomal protein L16  67.63 
 
 
158 aa  201  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  69.57 
 
 
144 aa  202  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  72.22 
 
 
143 aa  201  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1122  50S ribosomal protein L16  64.29 
 
 
161 aa  201  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  67.65 
 
 
140 aa  201  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2148  50S ribosomal protein L16  74.63 
 
 
138 aa  201  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0586575  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29670  LSU ribosomal protein L16P  68.89 
 
 
139 aa  200  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.810934  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  68.38 
 
 
140 aa  199  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2968  50S ribosomal protein L16  70.21 
 
 
138 aa  199  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.306381  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  72.86 
 
 
141 aa  199  9e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17090  50S ribosomal protein L16  68.09 
 
 
138 aa  199  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00239118  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  68.38 
 
 
140 aa  199  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1093  50S ribosomal protein L16  69.63 
 
 
139 aa  199  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17331  50S ribosomal protein L16  61.81 
 
 
160 aa  198  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.613797  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0594  ribosomal protein L16  68.89 
 
 
139 aa  198  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.158135  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 
140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 
140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2680  50S ribosomal protein L16  69.5 
 
 
138 aa  197  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  67.59 
 
 
141 aa  197  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0369  50S ribosomal protein L16  65.47 
 
 
158 aa  197  3e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0190  50S ribosomal protein L16  65.71 
 
 
140 aa  197  3e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  69.57 
 
 
138 aa  197  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1860  50S ribosomal protein L16  70.37 
 
 
141 aa  197  6e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0761083  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3898  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 
139 aa  197  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0634  ribosomal protein L16  68.15 
 
 
139 aa  196  7e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.953159  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  65 
 
 
140 aa  196  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319005  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1643  50S ribosomal protein L16  59.86 
 
 
160 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1353  50S ribosomal protein L16  67.91 
 
 
140 aa  195  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4500  ribosomal protein L16  65.22 
 
 
138 aa  195  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17581  50S ribosomal protein L16  59.86 
 
 
160 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4019  50S ribosomal protein L16  67.63 
 
 
141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261659  hitchhiker  0.00000510081 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1178  50S ribosomal protein L16  68.35 
 
 
141 aa  194  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371003  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17421  50S ribosomal protein L16  59.86 
 
 
160 aa  194  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0232  50S ribosomal protein L16  68.75 
 
 
143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2652  ribosomal protein L16  68.15 
 
 
138 aa  194  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3751  ribosomal protein L16  68.12 
 
 
138 aa  194  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.596484  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4314  ribosomal protein L16  69.63 
 
 
139 aa  193  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.827484  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5131  ribosomal protein L16  66.42 
 
 
137 aa  192  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77654 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0589  50S ribosomal protein L16  67.41 
 
 
138 aa  192  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1843  ribosomal protein L16  68.15 
 
 
137 aa  192  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000707867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>