53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2853 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  100 
 
 		 266 aa  553  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  93.98 
 
 		 266 aa  518  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  88.59 
 
 		 263 aa  484  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  87.45 
 
 		 263 aa  480  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  86.67 
 
 		 717 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  85.49 
 
 		 717 aa  460  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  85.1 
 
 		 717 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2837  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  91.26 
 
 		 183 aa  346  3e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0750475  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2843  hypothetical protein  99.02 
 
 		 102 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00805434  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  41.63 
 
 		 283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  39.92 
 
 		 283 aa  178  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  39.69 
 
 		 287 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  38.52 
 
 		 746 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  38.2 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  37.02 
 
 		 289 aa  145  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.58 
 
 		 599 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3055  hypothetical protein  80.56 
 
 		 94 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0517698  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  34.39 
 
 		 746 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  34.39 
 
 		 746 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  32.58 
 
 		 667 aa  99.8  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  31.02 
 
 		 255 aa  96.3  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  33.33 
 
 		 749 aa  95.9  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.09 
 
 		 970 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.31 
 
 		 970 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  30.66 
 
 		 955 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.05 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4368  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.65 
 
 		 217 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  32.95 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.91 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  27.67 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.95 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.28 
 
 		 201 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0265  bifunctional DNA primase/polymerase  29.44 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0228201  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  33.33 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  27.72 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06580  DNA primase/polymerase-like protein  36.59 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  31.29 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1688  Bifunctional DNA primase/polymerase  26.23 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0829  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.07 
 
 		 305 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4212  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.57 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567212  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0062  hypothetical protein  28.28 
 
 		 391 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8778  Bifunctional DNA primase/polymerase  26.67 
 
 		 223 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5495  Primase 2  32.5 
 
 		 305 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4436  Bifunctional DNA primase/polymerase  40.98 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2772  Bifunctional DNA primase/polymerase  23.64 
 
 		 1002 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0552  hypothetical protein  39.34 
 
 		 213 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2304  hypothetical protein  31.08 
 
 		 158 aa  47  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0886627  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  43.14 
 
 		 723 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1578  Bifunctional DNA primase/polymerase  25 
 
 		 1006 aa  45.4  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.357329 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1506  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.03 
 
 		 400 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  25.6 
 
 		 788 aa  43.9  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3896  hypothetical protein  32.94 
 
 		 692 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.425308  normal  0.91209 
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  33.33 
 
 		 757 aa  42.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>