35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2837 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2837  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  100 
 
 		 183 aa  378  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0750475  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  91.26 
 
 		 266 aa  346  1e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  87.43 
 
 		 263 aa  333  9e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  86.34 
 
 		 266 aa  326  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  85.79 
 
 		 263 aa  323  7e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  86.63 
 
 		 717 aa  308  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  85.47 
 
 		 717 aa  306  9e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  84.88 
 
 		 717 aa  306  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2843  hypothetical protein  91.18 
 
 		 102 aa  191  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00805434  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  41.71 
 
 		 283 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  40.57 
 
 		 283 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  38.42 
 
 		 287 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  39.23 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  38.25 
 
 		 289 aa  104  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  38.01 
 
 		 746 aa  104  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.91 
 
 		 599 aa  91.7  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  34.46 
 
 		 746 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  34.46 
 
 		 746 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  36.88 
 
 		 667 aa  69.3  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  40.19 
 
 		 749 aa  63.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  30.64 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5495  Primase 2  40 
 
 		 305 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  33.72 
 
 		 955 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  39.47 
 
 		 206 aa  48.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  36.36 
 
 		 377 aa  48.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  47.06 
 
 		 723 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  35.71 
 
 		 290 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.89 
 
 		 970 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.57 
 
 		 970 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  29.21 
 
 		 295 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  38.46 
 
 		 201 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4212  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.92 
 
 		 304 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567212  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  41.82 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  38.46 
 
 		 757 aa  41.6  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  39.29 
 
 		 788 aa  41.6  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>