52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2824 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  545  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  96.58 
 
 		 263 aa  528  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  93.25 
 
 		 717 aa  491  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  87.83 
 
 		 266 aa  484  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  87.45 
 
 		 266 aa  480  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  89.68 
 
 		 717 aa  474  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  90.48 
 
 		 717 aa  476  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2837  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  85.79 
 
 		 183 aa  323  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0750475  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2843  hypothetical protein  87.25 
 
 		 102 aa  185  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00805434  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  41.96 
 
 		 283 aa  179  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  40.08 
 
 		 746 aa  178  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  40.23 
 
 		 283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  39.08 
 
 		 287 aa  168  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  37.31 
 
 		 289 aa  155  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  38.17 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.96 
 
 		 599 aa  149  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3055  hypothetical protein  82.61 
 
 		 94 aa  123  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0517698  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  34.7 
 
 		 746 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  34.7 
 
 		 746 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  31.15 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  31.43 
 
 		 749 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  39.86 
 
 		 206 aa  95.9  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  31.58 
 
 		 667 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  30.81 
 
 		 955 aa  82.4  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.86 
 
 		 970 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.08 
 
 		 970 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  32.18 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.07 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.89 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.7 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4368  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.94 
 
 		 217 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  25.63 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  29.07 
 
 		 377 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5495  Primase 2  35.83 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  28.49 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8778  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.18 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4212  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.69 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567212  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  31.71 
 
 		 314 aa  55.5  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0265  bifunctional DNA primase/polymerase  29.38 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0228201  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0062  hypothetical protein  27.88 
 
 		 391 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06580  DNA primase/polymerase-like protein  33.85 
 
 		 317 aa  52.4  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1688  Bifunctional DNA primase/polymerase  26.78 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  28.05 
 
 		 723 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0829  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.25 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5574  Primase 2  27.84 
 
 		 1287 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246626 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2772  Bifunctional DNA primase/polymerase  26.99 
 
 		 1002 aa  48.9  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3896  hypothetical protein  36.36 
 
 		 692 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.425308  normal  0.91209 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4436  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.57 
 
 		 219 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0552  hypothetical protein  36.67 
 
 		 213 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2304  hypothetical protein  41.77 
 
 		 158 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0886627  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1506  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.38 
 
 		 400 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1578  Bifunctional DNA primase/polymerase  25.47 
 
 		 1006 aa  42.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.357329 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>