More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2817 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  100 
 
 		 141 aa  282  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  87.23 
 
 		 141 aa  250  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  44.78 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  41.04 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  41.04 
 
 		 163 aa  114  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  41.79 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  40.91 
 
 		 170 aa  103  9e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  37.68 
 
 		 160 aa  102  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  41.13 
 
 		 158 aa  100  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  39.72 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  40.32 
 
 		 158 aa  100  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  36.84 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  45.45 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  40.6 
 
 		 165 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  40.6 
 
 		 165 aa  99  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  39.42 
 
 		 238 aa  98.2  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  43.97 
 
 		 168 aa  98.2  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  39.1 
 
 		 168 aa  97.8  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  37.88 
 
 		 146 aa  97.1  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  38.57 
 
 		 158 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  38.71 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  43.97 
 
 		 165 aa  95.9  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  43.97 
 
 		 165 aa  95.9  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.06 
 
 		 164 aa  95.5  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  37.88 
 
 		 183 aa  95.9  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  39.39 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  37.4 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  39.26 
 
 		 159 aa  94.7  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  42.75 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  37.12 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  38.64 
 
 		 192 aa  94.7  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  36.36 
 
 		 163 aa  94.7  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  39.39 
 
 		 163 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  41.38 
 
 		 165 aa  94.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  42.24 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  40.52 
 
 		 164 aa  93.6  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  36.03 
 
 		 168 aa  93.6  9e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  37.88 
 
 		 167 aa  92.8  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  40.71 
 
 		 136 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  36.09 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  39.53 
 
 		 262 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  38.85 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  30.94 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  34.85 
 
 		 145 aa  90.9  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  29.37 
 
 		 161 aa  90.1  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  38.79 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  36.84 
 
 		 169 aa  89.4  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  38.46 
 
 		 169 aa  89.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.96 
 
 		 178 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  30.6 
 
 		 154 aa  88.6  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  33.58 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  35.16 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  35.71 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  41.28 
 
 		 179 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  36.03 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0206  CheW domain protein  37.3 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00161643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  32.09 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  37.96 
 
 		 187 aa  88.2  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  34.78 
 
 		 170 aa  87.8  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  38.79 
 
 		 166 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  30.6 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  40.52 
 
 		 164 aa  87.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  39.44 
 
 		 166 aa  87.4  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  34.06 
 
 		 170 aa  87  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  30.6 
 
 		 156 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  30.6 
 
 		 156 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2307  CheW protein  32.59 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  33.58 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.6 
 
 		 165 aa  85.5  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  33.33 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  40.37 
 
 		 179 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  32.88 
 
 		 218 aa  85.9  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  40.37 
 
 		 179 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  38.68 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  28.26 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  33.83 
 
 		 141 aa  84  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.59 
 
 		 170 aa  84  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  33.08 
 
 		 253 aa  84  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  38.06 
 
 		 179 aa  84  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  32.09 
 
 		 158 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  35.34 
 
 		 163 aa  83.6  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  33.1 
 
 		 160 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  34.53 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  37.14 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  32.09 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2363  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like protein  39.1 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  39.02 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  34.75 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  34.53 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  39.29 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  37.04 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  34.53 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  31.43 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  34.59 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  37.4 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  33.83 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  33.83 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1667  putative CheW protein  42.27 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.33191  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  34.06 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  36.67 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>