More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2784 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2784  cobalamin B12-binding protein  100 
 
 		 221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0108719  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  64.02 
 
 		 219 aa  290  1e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  62.62 
 
 		 219 aa  287  7e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  62.15 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  58.96 
 
 		 217 aa  264  7e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  56.13 
 
 		 220 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  60.09 
 
 		 219 aa  251  8.000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  47.09 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  44.93 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  45.71 
 
 		 214 aa  186  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  46.48 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  47.14 
 
 		 208 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0597  cobalamin B12-binding domain-containing protein  47.34 
 
 		 218 aa  180  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  43.13 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  41.75 
 
 		 208 aa  168  6e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  42.03 
 
 		 210 aa  168  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3658  cobalamin B12-binding domain-containing protein  40.1 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  42.44 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  43.92 
 
 		 213 aa  165  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  42.93 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  43.01 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  43.62 
 
 		 209 aa  159  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  40.49 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  39.52 
 
 		 218 aa  159  5e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  41.23 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  46.75 
 
 		 168 aa  158  7e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  38.89 
 
 		 804 aa  152  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  40.38 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  39.05 
 
 		 841 aa  151  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4611  cobalamin B12-binding domain protein  45.6 
 
 		 210 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.855843  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0720  cobalamin B12-binding domain protein  39.11 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  41.48 
 
 		 556 aa  148  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  42.86 
 
 		 839 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1895  cobalamin B12-binding domain protein  41.34 
 
 		 209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0024  methyltransferase cognate corrinoid protein  36.32 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  38.83 
 
 		 607 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  37.75 
 
 		 818 aa  145  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  45.57 
 
 		 224 aa  145  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2122  putative dimethylamine corrinoid protein  42.37 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.154357  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0797  methionine synthase  42.37 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.310628  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1107  cobalamin B12-binding domain protein  41.28 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1827  cobalamin B12-binding domain protein  38.22 
 
 		 213 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  37.07 
 
 		 804 aa  144  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  39.32 
 
 		 802 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4337  cobalamin B12-binding domain-containing protein  42.63 
 
 		 326 aa  143  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.125438  normal  0.389787 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2550  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  39.71 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  38.35 
 
 		 804 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1470  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  38.76 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  41.67 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  36.89 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  44.31 
 
 		 210 aa  142  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0539  cobalamin B12-binding domain protein  40.24 
 
 		 218 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4641  cobalamin B12-binding domain protein  41.67 
 
 		 213 aa  141  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  41.11 
 
 		 820 aa  141  9e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  37 
 
 		 801 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  37.86 
 
 		 804 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1603  cobalamin B12-binding domain protein  37.14 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000910131  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  38.12 
 
 		 800 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  34.86 
 
 		 806 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0847  monomethylamine corrinoid protein  36.92 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4321  cobalamin B12-binding domain protein  37.37 
 
 		 214 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3886  cobalamin B12-binding domain protein  35.71 
 
 		 215 aa  138  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000310147  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0707  methionine synthase  41.24 
 
 		 232 aa  138  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.784551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0840  monomethylamine corrinoid protein  36.92 
 
 		 217 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.960899  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  35.78 
 
 		 801 aa  135  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  36.45 
 
 		 804 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2310  trimethylamine corrinoid protein  37.56 
 
 		 216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00299987  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.17 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1368  trimethylamine corrinoid protein  37.07 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000818926  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  38 
 
 		 803 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  34.12 
 
 		 813 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  37.74 
 
 		 841 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  35.71 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  34.12 
 
 		 811 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2368  cobalamin B12-binding domain protein  39.16 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  35.24 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0845  monomethylamine corrinoid protein  37.63 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  40 
 
 		 791 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3634  monomethylamine corrinoid protein  38.86 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  33.66 
 
 		 804 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0842  monomethylamine corrinoid protein  38.14 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1041  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.02 
 
 		 211 aa  124  9e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.388992 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1835  cobalamin B12-binding domain protein  33.64 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  35.19 
 
 		 819 aa  122  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2929  cobalamin B12-binding domain protein  28.57 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000012726  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  37.57 
 
 		 816 aa  118  9e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2567  cobalamin B12-binding domain protein  33.93 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474708  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  34.88 
 
 		 807 aa  116  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2964  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.55 
 
 		 223 aa  112  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0486605  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1605  cobalamin B12-binding domain protein  32.84 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000212682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3881  cobalamin B12-binding domain protein  33.51 
 
 		 216 aa  111  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000148578  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0061  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.81 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  32.2 
 
 		 768 aa  107  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  31.4 
 
 		 617 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3584  methylthiol:coenzyme M methyltransferase  28.84 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812541  normal  0.0358178 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  32.79 
 
 		 780 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  32.35 
 
 		 774 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  31.82 
 
 		 793 aa  106  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1311  cobalamin B12-binding  30.59 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.460326 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0740  methanol corrinoid protein  31.6 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.970556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>