More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2752 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  100 
 
 
443 aa  918    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  54.62 
 
 
294 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  49.08 
 
 
352 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  48.99 
 
 
320 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  44.21 
 
 
348 aa  259  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  37.28 
 
 
390 aa  248  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2351  beta-lactamase domain-containing protein  48.7 
 
 
318 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3555  beta-lactamase domain-containing protein  43.73 
 
 
300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000166822  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  44.27 
 
 
292 aa  240  4e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  45.9 
 
 
291 aa  239  9e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  42.71 
 
 
406 aa  237  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1849  metallo-beta-lactamase family protein  46.25 
 
 
286 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000969274  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  34.87 
 
 
451 aa  222  9e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  43.95 
 
 
461 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  44.18 
 
 
284 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  43.55 
 
 
461 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  43.15 
 
 
461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  41.15 
 
 
421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  42.74 
 
 
461 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  42.74 
 
 
461 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  37.79 
 
 
283 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  37.45 
 
 
281 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  40.25 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1314  beta-lactamase domain-containing protein  31.48 
 
 
363 aa  176  9e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  34.94 
 
 
502 aa  174  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  36.5 
 
 
451 aa  172  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  35.74 
 
 
453 aa  172  1e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.8 
 
 
808 aa  170  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  38.49 
 
 
454 aa  169  8e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4102  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 
386 aa  168  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2771  beta-lactamase domain-containing protein  39.2 
 
 
367 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0044  beta-lactamase-like protein  35.95 
 
 
291 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.2 
 
 
778 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0389  hypothetical protein  33.58 
 
 
336 aa  159  8e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.211147  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.46 
 
 
780 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4165  metallo-beta-lactamase family protein  36.4 
 
 
300 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  36.8 
 
 
300 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1073  metallo-beta-lactamase family protein  35.6 
 
 
300 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.698038  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  36.36 
 
 
752 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  37.86 
 
 
479 aa  157  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  36 
 
 
300 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0140  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.34 
 
 
868 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038467 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  36 
 
 
300 aa  156  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.5 
 
 
761 aa  156  8e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3797  metallo-beta-lactamase  36.29 
 
 
300 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4076  metallo-beta-lactamase family protein  36.29 
 
 
300 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104735 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3966  metallo-beta-lactamase family protein  36.29 
 
 
300 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4275  metallo-beta-lactamase family protein  36.29 
 
 
300 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3812  metallo-beta-lactamase  36.29 
 
 
300 aa  154  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  36.43 
 
 
789 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2727  beta-lactamase domain protein  34.38 
 
 
374 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.83 
 
 
773 aa  152  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.57 
 
 
773 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.46 
 
 
773 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2283  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)-like protein  32.64 
 
 
342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  34.27 
 
 
300 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.77 
 
 
786 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.22 
 
 
750 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  33.71 
 
 
773 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.33 
 
 
773 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.01 
 
 
757 aa  145  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.33 
 
 
654 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.83 
 
 
773 aa  144  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.45 
 
 
818 aa  143  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.96 
 
 
773 aa  143  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.52 
 
 
770 aa  142  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2772  beta-lactamase-like  30.61 
 
 
257 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.619488  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.33 
 
 
772 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.33 
 
 
772 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.43 
 
 
759 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.97 
 
 
749 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  33.2 
 
 
795 aa  136  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.43 
 
 
795 aa  134  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.17 
 
 
791 aa  134  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.54 
 
 
682 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2499  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30 
 
 
783 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304772 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32 
 
 
775 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.57 
 
 
809 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2103  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.77 
 
 
812 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.858083  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0715  hypothetical protein  39.39 
 
 
274 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3048  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.32 
 
 
679 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1579  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.5 
 
 
883 aa  130  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0482933  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.23 
 
 
796 aa  130  6e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  32.63 
 
 
872 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2593  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.75 
 
 
767 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180843  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.3 
 
 
814 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.58 
 
 
811 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0782  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.07 
 
 
745 aa  128  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.15 
 
 
840 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1902  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.05 
 
 
880 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1867  beta-lactamase domain protein  32.63 
 
 
477 aa  127  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0121854 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  31.9 
 
 
872 aa  126  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.29 
 
 
778 aa  126  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5470  ComEC/Rec2-related protein  30.69 
 
 
819 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1942  beta-lactamase-like  29.46 
 
 
423 aa  125  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2686  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.35 
 
 
767 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00549034  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.08 
 
 
794 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.65 
 
 
797 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1520  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  33.2 
 
 
746 aa  124  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3468  ComEC/Rec2-related protein  31.65 
 
 
806 aa  122  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183145  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>