More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2729 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0312  elongation factor G  64.6 
 
 
695 aa  905  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000568119  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4484  elongation factor G  64.39 
 
 
700 aa  897  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.707132  normal  0.129741 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3714  elongation factor G  64.91 
 
 
704 aa  929  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.97299e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2843  elongation factor G  63.62 
 
 
700 aa  928  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52933  normal  0.221266 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0561  translation elongation factor G  63.44 
 
 
701 aa  900  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432328  hitchhiker  0.000385562 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2446  elongation factor G  63.49 
 
 
703 aa  901  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  1.47912e-07 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0273  elongation factor G  63.91 
 
 
700 aa  932  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823209  normal  0.369004 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0047  elongation factor G  62.2 
 
 
700 aa  889  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  2.9839e-09  decreased coverage  6.96868e-24 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3863  elongation factor G  63.48 
 
 
700 aa  902  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2552  elongation factor G  64.63 
 
 
703 aa  913  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975271  hitchhiker  0.000776621 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0324  elongation factor G  63.91 
 
 
700 aa  931  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00564924  normal  0.0493558 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4693  elongation factor G  63.04 
 
 
698 aa  885  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  8.36363e-06  unclonable  6.46786e-08 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4752  elongation factor G  60.99 
 
 
714 aa  896  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0168923  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3385  elongation factor G  61.12 
 
 
703 aa  895  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3621  elongation factor G  64.91 
 
 
704 aa  929  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.94361e-06  hitchhiker  0.000724432 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1397  elongation factor G  63.9 
 
 
695 aa  893  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000347651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0373  elongation factor G  64.91 
 
 
704 aa  929  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  4.19107e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3172  elongation factor G  63.53 
 
 
701 aa  910  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384126  hitchhiker  0.00453685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3647  elongation factor G  62.91 
 
 
700 aa  913  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  6.46434e-05  hitchhiker  4.15866e-10 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3300  elongation factor G  61.59 
 
 
723 aa  900  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00108075  hitchhiker  0.00222959 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  64.55 
 
 
699 aa  941  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  1.39334e-08 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3814  elongation factor G  64.63 
 
 
704 aa  910  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133333  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3643  elongation factor G  64.63 
 
 
704 aa  910  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  6.61479e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  71.22 
 
 
692 aa  1049  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  66.42 
 
 
697 aa  979  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  61.16 
 
 
692 aa  894  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  8.15728e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3642  elongation factor G  64.63 
 
 
704 aa  910  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.156207  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3751  elongation factor G  64.63 
 
 
704 aa  910  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.491712  normal  0.0846164 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3716  elongation factor G  64.63 
 
 
704 aa  910  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0927216  normal  0.0969109 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0286  elongation factor G  64.3 
 
 
704 aa  951  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00220543  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  65.29 
 
 
704 aa  963  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  3.38261e-05  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  66.14 
 
 
704 aa  964  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  70.97 
 
 
692 aa  1027  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  65.24 
 
 
704 aa  961  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.62154e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  63.31 
 
 
693 aa  931  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  74.89 
 
 
691 aa  1095  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.12943e-07  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0277  elongation factor G  64.81 
 
 
702 aa  919  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  1.12388e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  67.06 
 
 
689 aa  973  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3684  elongation factor G  62.03 
 
 
706 aa  905  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312611  hitchhiker  0.00286415 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3536  elongation factor G  64.91 
 
 
704 aa  929  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.52954e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00055  elongation factor G  65.09 
 
 
699 aa  914  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  65.38 
 
 
701 aa  939  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  4.45234e-07 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  65.75 
 
 
699 aa  956  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2733  translation elongation factor G  61.56 
 
 
691 aa  894  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.167208 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  62.61 
 
 
691 aa  885  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  1.61111e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  65.41 
 
 
692 aa  955  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  64.78 
 
 
691 aa  947  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3919  elongation factor G  64.81 
 
 
702 aa  919  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.96872e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  65.36 
 
 
691 aa  957  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  66.67 
 
 
697 aa  993  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  73.18 
 
 
692 aa  1069  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  5.83321e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  62.09 
 
 
698 aa  903  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.38252e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3223  elongation factor G  62.54 
 
 
730 aa  910  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0834  elongation factor G  62.39 
 
 
706 aa  891  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.757744  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0584  elongation factor G  66.23 
 
 
693 aa  942  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  7.68044e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3809  elongation factor G  64.91 
 
 
704 aa  929  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.25417e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4320  elongation factor G  63.81 
 
 
698 aa  892  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  5.82121e-06  unclonable  2.47136e-10 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4549  elongation factor G  62.22 
 
 
704 aa  896  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  4.85563e-08  normal  0.0800773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0481  elongation factor G  60.76 
 
 
714 aa  894  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0301247  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  76.38 
 
 
689 aa  1091  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  3.06199e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  72.74 
 
 
692 aa  1060  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.76822e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3675  elongation factor G  64.81 
 
 
702 aa  919  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  1.79981e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  65.75 
 
 
699 aa  956  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.03691e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0766  elongation factor G  64.3 
 
 
701 aa  914  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  3.20192e-05 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  63.77 
 
 
700 aa  931  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2307  translation elongation factor G  63.05 
 
 
700 aa  898  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0388  elongation factor G  61.97 
 
 
702 aa  890  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00665506  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0237  elongation factor G  67.99 
 
 
705 aa  1006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000318631  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  62.09 
 
 
698 aa  903  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  1.82182e-05 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16321  elongation factor G  63.78 
 
 
691 aa  912  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3277  elongation factor G  67.82 
 
 
701 aa  955  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0394176  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  61.77 
 
 
698 aa  886  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6052  elongation factor G  65.98 
 
 
698 aa  922  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0181  elongation factor G  63.52 
 
 
698 aa  900  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  3.44622e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  63.44 
 
 
691 aa  909  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  2.19808e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  64.17 
 
 
692 aa  940  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002299  translation elongation factor G  64.95 
 
 
699 aa  920  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.15857e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3804  translation elongation factor G  63.37 
 
 
701 aa  892  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587249  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0320  translation elongation factor G  65.52 
 
 
699 aa  939  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  4.39347e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4007  elongation factor G  64.35 
 
 
704 aa  905  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  2.80538e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  74.46 
 
 
689 aa  1088  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  70.6 
 
 
690 aa  1016  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  8.16454e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  62.01 
 
 
689 aa  904  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  4.50896e-07  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  72.86 
 
 
691 aa  1062  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.88442e-06  decreased coverage  2.4327e-05 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  76.09 
 
 
691 aa  1095  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0960  translation elongation factor G  65.38 
 
 
705 aa  906  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000224995  decreased coverage  7.93105e-13 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1164  translation elongation factor G  63.51 
 
 
698 aa  907  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  3.82661e-07  hitchhiker  1.23904e-06 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0584  translation elongation factor G  62.63 
 
 
699 aa  904  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19852  normal  0.151402 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2777  translation elongation factor G  63.99 
 
 
689 aa  923  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0295771  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  62.35 
 
 
690 aa  927  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  65.61 
 
 
700 aa  919  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  1.70843e-05  decreased coverage  8.39395e-11 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16260  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  64.5 
 
 
703 aa  890  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000508186  hitchhiker  1.782e-05 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  65.99 
 
 
706 aa  946  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  64.06 
 
 
703 aa  890  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  65.56 
 
 
692 aa  955  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  1.42734e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  67.39 
 
 
695 aa  939  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  60.89 
 
 
704 aa  880  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0559  translation elongation factor G  64.3 
 
 
700 aa  895  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.347154  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3467  translation elongation factor G  63.52 
 
 
701 aa  891  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0283568  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2662  translation elongation factor G  63.27 
 
 
700 aa  895  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>