More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2728 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 156 aa  320  4e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  79.49 
 
 		 156 aa  270  5.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  80.13 
 
 		 156 aa  268  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  80.89 
 
 		 157 aa  263  7e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  79.49 
 
 		 156 aa  256  8e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  78.21 
 
 		 156 aa  254  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  76.28 
 
 		 156 aa  253  7e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  75 
 
 		 156 aa  251  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  73.08 
 
 		 156 aa  250  7e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  73.08 
 
 		 156 aa  250  7e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  73.08 
 
 		 156 aa  250  7e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  72.44 
 
 		 156 aa  249  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  71.79 
 
 		 156 aa  248  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  71.79 
 
 		 156 aa  248  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  73.72 
 
 		 156 aa  246  7e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0236  30S ribosomal protein S7  71.79 
 
 		 156 aa  245  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000112284  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  73.08 
 
 		 156 aa  244  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  73.08 
 
 		 156 aa  244  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  73.08 
 
 		 156 aa  244  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  73.08 
 
 		 156 aa  244  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  73.08 
 
 		 156 aa  244  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  73.08 
 
 		 156 aa  244  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  73.08 
 
 		 156 aa  244  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  73.08 
 
 		 156 aa  243  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  71.15 
 
 		 156 aa  243  6.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  72.44 
 
 		 156 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  72.44 
 
 		 156 aa  241  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  71.15 
 
 		 156 aa  241  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 		 156 aa  239  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  70.51 
 
 		 156 aa  239  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  71.15 
 
 		 156 aa  239  1e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0221  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 		 156 aa  237  4e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000044788  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  71.15 
 
 		 156 aa  236  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  67.95 
 
 		 156 aa  233  7e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188797  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 		 156 aa  230  6e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  229  8.000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 		 156 aa  228  3e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 		 156 aa  224  3e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 		 156 aa  223  8e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 		 156 aa  223  1e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  66.23 
 
 		 155 aa  222  2e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 		 156 aa  221  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 		 156 aa  221  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  220  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  220  7e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf313  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  219  8e-57  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0990117  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 		 156 aa  219  8e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  64.74 
 
 		 156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  72.79 
 
 		 155 aa  218  3e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  72.79 
 
 		 155 aa  218  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0356  ribosomal protein S7  65.81 
 
 		 156 aa  218  3.9999999999999997e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000114638  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  217  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  64.33 
 
 		 157 aa  217  6e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  216  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  216  7.999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  65.58 
 
 		 155 aa  216  8.999999999999998e-56  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0076  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4325  ribosomal protein S7  64.74 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5120  ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.455087 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0613  30S ribosomal protein S7  65.58 
 
 		 155 aa  215  2e-55  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000989224  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  65.58 
 
 		 155 aa  214  2.9999999999999998e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20920  SSU ribosomal protein S7P  60.9 
 
 		 156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1064  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000327115  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  214  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  214  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0929  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 		 156 aa  214  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000450114  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  214  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  214  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3332  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 		 156 aa  214  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152337 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  214  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000656375  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  213  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2861  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  213  8e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0179023  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1659  30S ribosomal protein S7  67.57 
 
 		 156 aa  213  8e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.13751  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6618  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  213  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  213  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0683  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  213  9e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1280  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  213  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10697  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.786123 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3805  ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  212  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59243  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  213  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1013  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0985  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  212  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5077  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1003  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.725344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3468  ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1116  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0452  30S ribosomal protein S7  63.87 
 
 		 156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>