More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2720 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 141 aa  283  4e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  84.89 
 
 		 141 aa  250  5.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  77.3 
 
 		 141 aa  230  5e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  77.7 
 
 		 141 aa  227  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  77.7 
 
 		 141 aa  227  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  75.71 
 
 		 141 aa  223  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  75.18 
 
 		 141 aa  223  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  75.18 
 
 		 141 aa  222  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  75.71 
 
 		 141 aa  221  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  75.18 
 
 		 140 aa  220  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 		 141 aa  216  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 		 141 aa  216  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 		 141 aa  216  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 		 141 aa  216  6e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 		 141 aa  216  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 		 141 aa  216  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 		 141 aa  216  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 		 141 aa  216  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 		 141 aa  216  6e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 		 141 aa  216  6e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 		 141 aa  216  6e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  73.38 
 
 		 142 aa  216  7e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  76.26 
 
 		 141 aa  215  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  69.5 
 
 		 141 aa  214  4e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  73.24 
 
 		 142 aa  213  5.9999999999999996e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  71.43 
 
 		 140 aa  213  7e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  70 
 
 		 141 aa  213  9e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  72.99 
 
 		 142 aa  211  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  72.99 
 
 		 142 aa  209  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 141 aa  209  7.999999999999999e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 		 141 aa  209  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  70.8 
 
 		 140 aa  209  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  71.53 
 
 		 140 aa  208  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  70.8 
 
 		 140 aa  209  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0353  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 141 aa  207  3e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000273622  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  69.5 
 
 		 141 aa  207  5e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  70.07 
 
 		 141 aa  206  7e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  70 
 
 		 140 aa  206  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  71.43 
 
 		 140 aa  204  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  70.8 
 
 		 140 aa  205  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  71.43 
 
 		 140 aa  204  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  70.07 
 
 		 140 aa  204  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 		 140 aa  203  6e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  70.07 
 
 		 140 aa  203  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 141 aa  203  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 141 aa  203  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  70.07 
 
 		 141 aa  203  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3693  ribosomal protein L11  75.35 
 
 		 142 aa  202  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000590781  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 140 aa  202  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  67.15 
 
 		 141 aa  201  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 141 aa  200  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 141 aa  200  5e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  64.54 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 142 aa  197  3.9999999999999996e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 		 140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 141 aa  196  7.999999999999999e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  65.96 
 
 		 143 aa  193  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0192  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 141 aa  193  8.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000446828  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 164 aa  192  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0302  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 143 aa  191  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 143 aa  192  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 141 aa  191  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 143 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 143 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 143 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 143 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 143 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 143 aa  191  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 143 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  64.75 
 
 		 143 aa  191  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 143 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0315  50S ribosomal protein L11  68.57 
 
 		 141 aa  190  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000425279  hitchhiker  0.000807121 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 140 aa  190  5e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 141 aa  190  7e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 		 141 aa  190  7e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 141 aa  190  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 140 aa  189  8e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3656  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 143 aa  189  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00490061  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1966  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.42861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4680  50S ribosomal protein L11  67.63 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00022611  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0042  50S ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000150349  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2683  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000789076  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2156  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0919781  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2471  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.407768  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  63.77 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0993  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 140 aa  187  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000134652  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2724  ribosomal protein L11  70.45 
 
 		 143 aa  187  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.239254  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 		 141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0264  50S ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 143 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0928671  normal  0.597405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>