40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2694 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  100 
 
 		 532 aa  1079    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  27.84 
 
 		 540 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  28.02 
 
 		 781 aa  94.7  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  26.02 
 
 		 457 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  25.71 
 
 		 457 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  23.45 
 
 		 461 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  25.53 
 
 		 475 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  23.08 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  23.79 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  26.45 
 
 		 467 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  24.84 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2933  O-antigen polymerase  22.53 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205816  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  25.66 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  23.29 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  25.74 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2333  O-antigen polymerase  20.46 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  22.81 
 
 		 496 aa  57.4  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3700  hypothetical protein  25.24 
 
 		 480 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160795  normal  0.238064 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  23.08 
 
 		 467 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  24.82 
 
 		 492 aa  55.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2722  O-antigen polymerase  27.14 
 
 		 497 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.616494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  26.07 
 
 		 474 aa  51.6  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3495  hypothetical protein  24.29 
 
 		 617 aa  50.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000341769  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1242  hypothetical protein  25.26 
 
 		 427 aa  51.2  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.684679  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  25 
 
 		 500 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  23.02 
 
 		 438 aa  48.5  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1241  hypothetical protein  25.13 
 
 		 396 aa  48.5  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  19.38 
 
 		 467 aa  47.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  26.8 
 
 		 435 aa  47.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  23.14 
 
 		 503 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  24.43 
 
 		 501 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  22.14 
 
 		 737 aa  47  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8491  O-antigen polymerase  22.34 
 
 		 469 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  20.99 
 
 		 459 aa  45.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  25.86 
 
 		 436 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1569  O-antigen polymerase  21.89 
 
 		 489 aa  45.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  24.71 
 
 		 498 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  25 
 
 		 754 aa  44.3  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  24.2 
 
 		 428 aa  43.9  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  23.05 
 
 		 438 aa  43.9  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>