More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2644 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2644  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  100 
 
 
389 aa  806    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16970  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  54.07 
 
 
391 aa  450  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1974  DegT/DnrJ/EryC1/StrS family protein  48.44 
 
 
384 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.953061  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0752  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.41 
 
 
368 aa  311  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.582657 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0593  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.47 
 
 
383 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2405  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.1 
 
 
402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.12432  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4084  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.91 
 
 
392 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0525  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.04 
 
 
395 aa  271  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2305  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein  37.94 
 
 
383 aa  271  1e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3387  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.63 
 
 
381 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2345  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.63 
 
 
382 aa  256  4e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0393  aminotransferase  37.87 
 
 
380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2633  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.69 
 
 
390 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152572  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3253  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.92 
 
 
384 aa  252  6e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1514  aminotransferase  37.95 
 
 
381 aa  252  8.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5132  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.14 
 
 
380 aa  252  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5394  aminotransferase family protein  35.43 
 
 
371 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2521  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.44 
 
 
369 aa  249  4e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162044 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0563  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.77 
 
 
381 aa  250  4e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0037  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.59 
 
 
379 aa  249  7e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0792  hypothetical protein  34.99 
 
 
500 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3134  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.27 
 
 
368 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2970  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  39.22 
 
 
364 aa  247  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000014581 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3048  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.13 
 
 
382 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14101  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  38.46 
 
 
398 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1586  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.12 
 
 
382 aa  247  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.257863  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2600  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  41.87 
 
 
362 aa  247  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2329  pyridoxal phosphate-dependent enzyme apparently involved in regulation of cell wall biogenesis  34.86 
 
 
385 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00668  UDP-bacillosamine synthetase  36.22 
 
 
383 aa  246  6e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0047  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.69 
 
 
386 aa  246  6e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0629  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.6 
 
 
384 aa  245  8e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0821  hypothetical protein  34.73 
 
 
500 aa  244  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1461  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.97 
 
 
399 aa  245  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2587  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.44 
 
 
383 aa  244  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0384123  hitchhiker  0.000234634 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01121  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  37.85 
 
 
395 aa  242  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.273629 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0950  putative perosamine synthetase  36.18 
 
 
365 aa  241  1e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.251305  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3098  UDP-bacillosamine synthetase  34.84 
 
 
385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1355  perosamine synthetase, putative  36.44 
 
 
364 aa  239  5.999999999999999e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1257  UDP-4-keto-6-deoxy-GlcNAc C4 aminotransferase  35.97 
 
 
386 aa  238  1e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0312  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.96 
 
 
387 aa  238  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.991338  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2644  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.34 
 
 
394 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1139  general glycosylation pathway protein  34.02 
 
 
386 aa  237  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.957255  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0171  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.49 
 
 
381 aa  237  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0252  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.49 
 
 
381 aa  237  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0599  general glycosylation pathway protein  34.28 
 
 
386 aa  237  3e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1264  general glycosylation pathway protein  34.02 
 
 
386 aa  236  4e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.905092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3402  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.2 
 
 
507 aa  236  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2126  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.24 
 
 
372 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0334323  normal  0.0133651 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1203  putative perosamine synthetase  35.49 
 
 
363 aa  234  3e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12411  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  35.28 
 
 
407 aa  232  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.485468  hitchhiker  0.0071561 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0369  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.11 
 
 
389 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1964  perosamine synthetase  31.51 
 
 
591 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0448  processing protease  35.14 
 
 
363 aa  230  3e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0666  aminotransferase  31.43 
 
 
586 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0571  aminotransferase  31.51 
 
 
586 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1981  perosamine synthetase  31.03 
 
 
591 aa  229  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0080  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  35.14 
 
 
371 aa  229  9e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0082  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.14 
 
 
371 aa  229  9e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0714  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.79 
 
 
375 aa  228  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2577  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.97 
 
 
365 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176672  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2624  perosamine synthase  33.33 
 
 
367 aa  227  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4858  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.54 
 
 
395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707328  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1589  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.16 
 
 
370 aa  226  7e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001802  putative aminotransferase DegT family  32.7 
 
 
383 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5255  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.59 
 
 
381 aa  223  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3059  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.43 
 
 
370 aa  222  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4223  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  35.09 
 
 
374 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206706  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3119  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.78 
 
 
391 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2975  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.78 
 
 
391 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0521  perosamine synthase, putative  32.02 
 
 
367 aa  219  8.999999999999998e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0711  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein  34.25 
 
 
388 aa  218  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1969  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.42 
 
 
384 aa  216  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.886816  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3629  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.83 
 
 
372 aa  215  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0334  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.25 
 
 
377 aa  213  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.272347  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2766  perosamine synthetase  34.11 
 
 
368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0594  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  33.68 
 
 
372 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3986  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.03 
 
 
383 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0289  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.57 
 
 
367 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2570  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.01 
 
 
372 aa  209  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10738  putative aminotransferase  33.6 
 
 
365 aa  204  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.250686  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1573  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.47 
 
 
500 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1514  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.63 
 
 
373 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3660  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  29.35 
 
 
383 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795674  normal  0.3486 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4737  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  29.35 
 
 
383 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.301664 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3378  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.53 
 
 
368 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.65764  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1460  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.25 
 
 
363 aa  199  7e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.594691  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0361  aminotransferase-like  28.94 
 
 
383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0665  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.76 
 
 
378 aa  198  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3061  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.31 
 
 
393 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2836  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.22 
 
 
366 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281865  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3652  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.41 
 
 
403 aa  196  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0056  perosamine synthetase  30.42 
 
 
375 aa  195  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0267366  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3157  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.27 
 
 
371 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0486  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.56 
 
 
403 aa  194  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1361  glutamine--scyllo-inositol transaminase  30.98 
 
 
407 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248455  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1137  aspartate aminotransferase  31.69 
 
 
360 aa  190  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0364  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.4 
 
 
383 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5668  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.59 
 
 
385 aa  189  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.01985 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1998  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.04 
 
 
389 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1213  cell wall biosynthesis enzyme  30.89 
 
 
368 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.578129  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>