More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2643 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2643  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 348 aa  702    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0757  nucleotidyl transferase  39.46 
 
 		 354 aa  253  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2394  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 346 aa  212  7.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4088  nucleotidyl transferase  34.12 
 
 		 351 aa  202  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  31.44 
 
 		 476 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0633  Nucleotidyl transferase  32.42 
 
 		 353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0560  nucleotidyl transferase  32.15 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3126  nucleotidyl transferase  34.51 
 
 		 350 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2982  nucleotidyl transferase  34.51 
 
 		 350 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0566081  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1456  nucleotidyl transferase  34.31 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0365  Nucleotidyl transferase  32.08 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4857  nucleotidyl transferase  29.02 
 
 		 351 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01171  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  33.66 
 
 		 320 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0529  Nucleotidyl transferase  31.44 
 
 		 352 aa  183  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3979  Nucleotidyl transferase  30.09 
 
 		 360 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0598  nucleotidyl transferase  31.42 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.534705  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2585  nucleotidyl transferase  29.58 
 
 		 367 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2335  putative sugar-phosphate nucleotide transferase  31.69 
 
 		 352 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0321237  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3102  mannose-1-phosphate guanyltransferase  30.97 
 
 		 352 aa  169  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1580  nucleotidyl transferase  30.18 
 
 		 352 aa  169  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.995766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2301  nucleotidyl transferase  30.31 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1231  flagellin modification protein PtmE, putative sugar-phosphate nucleotide transferase  33.23 
 
 		 345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000208573  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12391  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  31.79 
 
 		 353 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0812001  normal  0.0145083 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0051  nucleotidyl transferase  31.58 
 
 		 351 aa  162  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1518  nucleotidyltransferase family protein  32.18 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.973367  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0380  nucleotidyltransferase family protein  32.18 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001798  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  31.5 
 
 		 352 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0256  nucleotidyl transferase  32.56 
 
 		 352 aa  156  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0167  nucleotidyl transferase  32.56 
 
 		 352 aa  156  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  37.18 
 
 		 238 aa  155  9e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00676  mannose-1-phosphate guanyltransferase  30.61 
 
 		 352 aa  153  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  31.72 
 
 		 238 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0885  Nucleotidyl transferase  33.92 
 
 		 229 aa  143  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0409  Nucleotidyl transferase  32.91 
 
 		 237 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.359368 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14051  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25.42 
 
 		 356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3723  Nucleotidyl transferase  32.72 
 
 		 240 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3557  nucleotidyl transferase  30.18 
 
 		 238 aa  126  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  34.35 
 
 		 843 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  32.87 
 
 		 238 aa  123  5e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5131  Nucleotidyl transferase  31.53 
 
 		 243 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  31.3 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  28 
 
 		 854 aa  117  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0481  nucleotidyl transferase  30.04 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.436885 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  34.09 
 
 		 816 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  31.03 
 
 		 821 aa  116  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4321  Nucleotidyl transferase  27.51 
 
 		 238 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.58 
 
 		 842 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  31.72 
 
 		 828 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  31.8 
 
 		 810 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  27.95 
 
 		 837 aa  115  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  30.48 
 
 		 776 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  31.53 
 
 		 828 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  30 
 
 		 834 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  32.59 
 
 		 818 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  31.7 
 
 		 842 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  31.84 
 
 		 347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  30.13 
 
 		 841 aa  114  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  32 
 
 		 840 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  34.38 
 
 		 827 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1119  nucleotidyl transferase  30.67 
 
 		 225 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0230664 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  30.51 
 
 		 712 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  29.58 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  30.53 
 
 		 833 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  30.7 
 
 		 832 aa  110  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  30.49 
 
 		 347 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  31.56 
 
 		 841 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  30.09 
 
 		 842 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  30.13 
 
 		 784 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  30.13 
 
 		 784 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  30.13 
 
 		 784 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  27.47 
 
 		 828 aa  107  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  30.13 
 
 		 784 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  30.13 
 
 		 784 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  27.75 
 
 		 828 aa  106  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  31.42 
 
 		 820 aa  106  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  27.95 
 
 		 843 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  28.7 
 
 		 842 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  30.47 
 
 		 832 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  28.25 
 
 		 346 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  30.13 
 
 		 784 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12931  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  31.07 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.126471  hitchhiker  0.00767012 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  29.07 
 
 		 827 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  30.36 
 
 		 830 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  29.02 
 
 		 835 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  28.96 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  29 
 
 		 832 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  27.85 
 
 		 357 aa  102  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  29.69 
 
 		 784 aa  102  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  29.69 
 
 		 784 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  29.26 
 
 		 784 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  29.11 
 
 		 833 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  29.26 
 
 		 784 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0072  nucleotidyl transferase  25.45 
 
 		 225 aa  100  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.155346 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  30.53 
 
 		 370 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  29.2 
 
 		 820 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  29.02 
 
 		 836 aa  100  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1857  nucleotidyl transferase  33.68 
 
 		 220 aa  99.8  7e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.58805 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  28 
 
 		 785 aa  99.4  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2143  putative guanyltransferase  28.29 
 
 		 240 aa  98.6  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.187528  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1138  nucleotidyl transferase  30.7 
 
 		 227 aa  99  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>