154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2641 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  100 
 
 
330 aa  678    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  64.35 
 
 
331 aa  431  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  59.04 
 
 
335 aa  412  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  61.63 
 
 
333 aa  413  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  59.39 
 
 
333 aa  412  1e-114  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  60.12 
 
 
334 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  59.7 
 
 
334 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  59.7 
 
 
334 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  55.62 
 
 
337 aa  385  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  56.4 
 
 
341 aa  378  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  53.33 
 
 
338 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  56.02 
 
 
334 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  56.02 
 
 
334 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  53.31 
 
 
334 aa  366  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  55.42 
 
 
332 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  53.33 
 
 
337 aa  361  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  53.29 
 
 
346 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  52.41 
 
 
333 aa  356  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  54.38 
 
 
333 aa  355  6.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0254  N-acetylneuraminic acid synthase  50.14 
 
 
357 aa  352  4e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0169  N-acetylneuraminic acid synthase  50.14 
 
 
357 aa  352  4e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.922982  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  50.42 
 
 
357 aa  352  5e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  51.67 
 
 
349 aa  349  3e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  49.29 
 
 
357 aa  350  3e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  50.42 
 
 
363 aa  349  5e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  50.14 
 
 
359 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  51.05 
 
 
346 aa  339  4e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3100  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  49.58 
 
 
357 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  47.31 
 
 
359 aa  328  6e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  48.62 
 
 
347 aa  322  7e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  50.96 
 
 
348 aa  321  9.000000000000001e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.09 
 
 
358 aa  317  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  48.45 
 
 
340 aa  310  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01101  sialic acid synthase  47.76 
 
 
335 aa  309  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  48.45 
 
 
340 aa  309  5e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14081  sialic acid synthase  47.75 
 
 
341 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2396  NeuB, antifreeze-like protein  46.46 
 
 
371 aa  290  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  44.98 
 
 
350 aa  286  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.09 
 
 
349 aa  286  4e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0367  N-acetylneuraminate synthase  43.75 
 
 
360 aa  277  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  45.28 
 
 
350 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  41.28 
 
 
350 aa  268  8e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  43.45 
 
 
354 aa  263  2e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  44.62 
 
 
350 aa  263  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  42.55 
 
 
342 aa  258  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.55 
 
 
749 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4853  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.66 
 
 
352 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  43.47 
 
 
748 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  39.56 
 
 
350 aa  239  5.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.7 
 
 
354 aa  237  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.18 
 
 
394 aa  237  3e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3448  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  44.72 
 
 
749 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2668  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  44.72 
 
 
749 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.26 
 
 
338 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.42 
 
 
351 aa  230  2e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  37.96 
 
 
332 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  39.11 
 
 
672 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  37.73 
 
 
350 aa  225  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1912  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.65 
 
 
365 aa  223  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000713145 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  39.51 
 
 
343 aa  223  4e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  39.13 
 
 
337 aa  222  7e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  35.62 
 
 
349 aa  219  7e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  38.04 
 
 
338 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  36.76 
 
 
348 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  36.91 
 
 
349 aa  216  5e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1890  N-acetylneuraminate synthase  37.16 
 
 
356 aa  216  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000120962  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.8 
 
 
345 aa  216  5.9999999999999996e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0010  n-acetylneuraminate synthase  38.89 
 
 
303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124512  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  36.78 
 
 
338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2635  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.75 
 
 
352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.27 
 
 
344 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1894  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.45 
 
 
354 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  39.2 
 
 
351 aa  210  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14241  sialic acid synthase  37.08 
 
 
356 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.532641  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  36.17 
 
 
348 aa  210  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1974  N-acetylneuraminate synthase  43.56 
 
 
305 aa  210  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  35.4 
 
 
350 aa  209  5e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2221  N-acetylneuraminate synthase  39.02 
 
 
761 aa  208  8e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1556  sialic acid synthase  39.45 
 
 
340 aa  208  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.14 
 
 
350 aa  206  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4334  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.42 
 
 
356 aa  205  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08721  ialic acid synthase  35.69 
 
 
342 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  hitchhiker  0.00000164183 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  36.31 
 
 
345 aa  203  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0305  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  39.38 
 
 
347 aa  202  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.351224  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0397  N-acetylneuraminic acid synthetase  40.24 
 
 
343 aa  202  9e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.397069  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  34.18 
 
 
349 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  35.17 
 
 
350 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.19 
 
 
358 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0565  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsE  37.08 
 
 
342 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  35.26 
 
 
364 aa  200  3e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1158  sialic acid synthase  37.35 
 
 
346 aa  200  3e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00143382  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2407  N-acetylneuraminate synthase  35.19 
 
 
500 aa  199  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378262  normal  0.284066 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1334  N-acetylneuraminic acid synthetase  41.16 
 
 
343 aa  199  5e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3564  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.39 
 
 
343 aa  199  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.65 
 
 
349 aa  199  7.999999999999999e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.78 
 
 
350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1664  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.56 
 
 
344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0797  N-acetylneuraminate synthase  37.97 
 
 
289 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  35.74 
 
 
352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1274  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.64 
 
 
314 aa  196  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>