More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2630 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2630  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
320 aa  644    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  81.45 
 
 
319 aa  536  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  72.64 
 
 
325 aa  481  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.72 
 
 
319 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.09 
 
 
319 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.09 
 
 
316 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.5 
 
 
315 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.78 
 
 
313 aa  409  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.05 
 
 
315 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.23 
 
 
317 aa  403  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.23 
 
 
317 aa  403  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.23 
 
 
317 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.23 
 
 
317 aa  403  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.23 
 
 
317 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.23 
 
 
317 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.23 
 
 
317 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.23 
 
 
317 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.9 
 
 
317 aa  403  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.23 
 
 
317 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.23 
 
 
317 aa  403  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.97 
 
 
322 aa  398  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.13 
 
 
315 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.25 
 
 
316 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.91 
 
 
314 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.92 
 
 
322 aa  391  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  59.16 
 
 
317 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.81 
 
 
317 aa  383  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.2 
 
 
318 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0873  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.06 
 
 
324 aa  382  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.97 
 
 
314 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  59.55 
 
 
327 aa  379  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
329 aa  376  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.05 
 
 
327 aa  370  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.37 
 
 
314 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.06 
 
 
314 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  59.49 
 
 
312 aa  363  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0640  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.87 
 
 
318 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00660234  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.39 
 
 
314 aa  361  9e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.45 
 
 
325 aa  359  4e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.59 
 
 
316 aa  359  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.28 
 
 
321 aa  358  5e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.91 
 
 
329 aa  358  7e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.48 
 
 
312 aa  358  9e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.9 
 
 
323 aa  357  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.2 
 
 
316 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.79 
 
 
309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.84 
 
 
312 aa  356  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.15 
 
 
321 aa  355  5e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.15 
 
 
321 aa  355  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.88 
 
 
316 aa  355  5e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
338 aa  355  7.999999999999999e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.15 
 
 
321 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1674  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.86 
 
 
327 aa  354  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.19 
 
 
338 aa  353  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0138  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.52 
 
 
321 aa  352  2.9999999999999997e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.056526  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.79 
 
 
309 aa  353  2.9999999999999997e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.45 
 
 
359 aa  352  4e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.79 
 
 
309 aa  352  5e-96  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.47 
 
 
309 aa  352  5e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.49 
 
 
324 aa  352  7e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1642  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.73 
 
 
323 aa  351  7e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0018  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.69 
 
 
322 aa  351  8.999999999999999e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00325732  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.17 
 
 
309 aa  351  8.999999999999999e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.87 
 
 
330 aa  351  8.999999999999999e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0043  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.01 
 
 
321 aa  351  8.999999999999999e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.270111  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1492  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.33 
 
 
317 aa  350  1e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1409  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.36 
 
 
317 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70704  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.1 
 
 
327 aa  350  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.48 
 
 
330 aa  349  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0522  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.74 
 
 
321 aa  348  5e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00402651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0535  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.74 
 
 
321 aa  348  5e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0143488  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0985  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.33 
 
 
331 aa  348  5e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107036  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  55.27 
 
 
321 aa  348  6e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
325 aa  347  1e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
324 aa  347  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.23 
 
 
318 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.1 
 
 
323 aa  347  2e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.23 
 
 
318 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.32 
 
 
317 aa  347  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.1 
 
 
317 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384244  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.38 
 
 
320 aa  346  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.77 
 
 
314 aa  346  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.16 
 
 
316 aa  345  5e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0951  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.18 
 
 
324 aa  345  6e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  52.7 
 
 
326 aa  345  6e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
319 aa  345  8e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3177  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.13 
 
 
310 aa  345  8e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2365  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.69 
 
 
316 aa  344  1e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  54.17 
 
 
313 aa  344  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.68 
 
 
330 aa  344  1e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3879  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.73 
 
 
317 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409064  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2416  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.24 
 
 
316 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0715915  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4846  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.1 
 
 
317 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.15 
 
 
315 aa  342  2.9999999999999997e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.73 
 
 
331 aa  342  5e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1709  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.12 
 
 
310 aa  342  5.999999999999999e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347929  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.66 
 
 
321 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  54.66 
 
 
321 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.55 
 
 
312 aa  342  5.999999999999999e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.95 
 
 
315 aa  341  9e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>